RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488612.5

RAD51B-212, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 1,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-212ENST00000488612 PLAAQ9Y263 795 aa7.96□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 MED16Q9Y2X0 877 aa7.96□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.96□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 A0A1B0GVT2 93 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SMIM23A6NLE4 172 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 A6NNZ2 444 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ERLIN1O75477 346 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CDK14O94921 469 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ASMTLO95671 621 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ITGB6P18564 788 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 PMLP29590 882 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 PHBP35232 272 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SLCO1A2P46721 670 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 RABIFP47224 123 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 TTPAP49638 278 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 KIAA1024LP59773 190 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 BMPR2Q13873 1038 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 FZD2Q14332 565 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 NFATC4Q14934 902 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ENPP7Q6UWV6 458 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 RBFAQ8N0V3 343 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 IQCKQ8N0W5 287 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CYP4X1Q8N118 509 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 KRT222Q8N1A0 295 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 TCEAL3Q969E4 200 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ULK4Q96C45 1275 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ZIM3Q96PE6 472 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CYTH2Q99418 400 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 COPS8Q99627 209 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SLC30A3Q99726 388 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CAB39LQ9H9S4 337 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF446Q9NWS9 450 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 EURLQ9NYK6 297 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 GULP1Q9UBP9 304 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SLC23A2Q9UGH3 650 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SUFUQ9UMX1 484 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 PRSS38A1L453 326 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 TLR4O00206 839 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CHUKO15111 745 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 NUAK1O60285 661 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 NIPSNAP2O75323 286 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 NDUFS3O75489 264 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SASH3O75995 380 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 RHOBTB1O94844 696 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 NUDT17P0C025 328 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 MSH3P20585 1137 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 NUDT1P36639 197 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CD151P48509 253 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CDKN2DP55273 166 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 YPEL5P62699 121 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF460Q14592 562 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ITIH4Q14624 930 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CASP8Q14790 479 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ALG11Q2TAA5 492 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 PIM3Q86V86 326 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 C11orf74Q86VG3 221 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SLC26A11Q86WA9 606 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 LRRC6Q86X45 466 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SYT12Q8IV01 421 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 OR56A4Q8NGH8 313 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 CALML6Q8TD86 181 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 ANKRD7Q92527 254 aa7.94□□□□□ -1.14
RAD51B-212ENST00000488612 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.148e-7■■■■■ 66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms