RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 RCAN2Q14206 197 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 ADRM1Q16186 407 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 OGFOD2Q6N063 350 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 FNDC5Q8NAU1 212 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 CD200R1Q8TD46 325 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 HIC2Q96JB3 615 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 TMEM74Q96NL1 305 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 TTPALQ9BTX7 342 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 H3BNH8 94 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 GSK3BP49841 420 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 LIPEQ05469 1076 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 HECTD3Q5T447 861 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 ANKS3Q6ZW76 656 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 CAMK1DQ8IU85 385 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 OR52B6Q8NGF0 335 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 COMMD10Q9Y6G5 202 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-207ENST00000462494 GBF1Q92538 1859 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 ILVBLA1L0T0 632 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 TBC1D4O60343 1298 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 SNAP91O60641 907 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 GNAO1P09471 354 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 PRR35P0CG20 571 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 CDH15P55291 814 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 FOXM1Q08050 763 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 SMARCB1Q12824 385 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 TRAF2Q12933 501 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 COQ5Q5HYK3 327 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 EPHX4Q8IUS5 362 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 ADGRG5Q8IZF4 528 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 TFAP2CQ92754 450 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 TMIGD2Q96BF3 282 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 HBEGFQ99075 208 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 SUN2Q9UH99 717 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 V9GYQ6 96 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 CHD5Q8TDI0 1954 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 E2F3O00716 465 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 KLK8O60259 260 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 F11P03951 625 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 XKR7Q5GH72 579 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 MYRFLQ96LU7 910 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 SMOXQ9NWM0 555 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 OAZ3Q9UMX2 235 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 USP22Q9UPT9 525 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 EEDO75530 441 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 STC2O76061 302 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 TMCC1O94876 653 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 GALTP07902 379 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 ZNF23P17027 643 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 TM4SF4P48230 202 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 ERVK-8P63133 956 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 ARF5P84085 180 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 TGFBIQ15582 683 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 TMEM199Q8N511 208 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 PFDN4Q9NQP4 134 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 CEPT1Q9Y6K0 416 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 A0A1B0GVM2 712 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 NBNO60934 754 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 C1RP00736 705 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 MT-ND1P03886 318 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 ASLP04424 464 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 IL12AP29459 219 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 OR1D2P34982 312 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 ERVPABLB-1P60509 514 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-207ENST00000462494 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.75■□□□□ 0.27
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