RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf54Q8WWF1 131 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 BAP1Q92560 729 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ELP4Q96EB1 424 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FICDQ9BVA6 458 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 BCO1Q9HAY6 547 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 DZANK1Q9NVP4 752 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 STUB1Q9UNE7 303 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PQJ5 194 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FAM83GA6ND36 823 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SYN3O14994 580 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MID1O15344 667 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 XYLBO75191 536 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RPP14O95059 124 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 GSRP00390 522 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PRKCGP05129 697 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 URODP06132 367 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CYP21A2P08686 494 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ANXA5P08758 320 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CYP2A7P20853 494 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PTENP60484 403 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 BLOC1S1P78537 153 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP8P85298 464 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MBTD1Q05BQ5 628 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CHRNA6Q15825 494 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TAC4Q86UU9 113 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 EFCAB3Q8N7B9 438 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF596Q8TC21 504 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CREB3L1Q96BA8 519 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FAM89AQ96GI7 184 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ITGA11Q9UKX5 1188 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0U1RQJ8 604 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GV90 55 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 AGAP5A6NIR3 686 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 DBX1A6NMT0 343 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SCO2O43819 266 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SOAT2O75908 522 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CTSHP09668 335 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CERS1P27544 350 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MERTKQ12866 999 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM199Q8N511 208 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF671Q8TAW3 534 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 LPGAT1Q92604 370 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 EXTL1Q92935 676 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A18Q96BI1 424 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FAM227BQ96M60 508 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RNF32Q9H0A6 362 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 METTL9Q9H1A3 318 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 NT5MQ9NPB1 228 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 GGA3Q9NZ52 723 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 STK36Q9NRP7 1315 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GTQ1 180 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L4A6NCW7 530 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 INPP4BO15327 924 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PLA2G6O60733 806 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 AKR7A3O95154 331 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 POP4O95707 220 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CSTAP01040 98 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CSN2P05814 226 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ADRB1P08588 477 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L8P0C7I0 530 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 HSD3B2P26439 372 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms