RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 FOXC1Q12948 553 aa23.52■■□□□ 1.36
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UBE2E3-202ENST00000410062 OGFOD3Q6PK18 319 aa23.52■■□□□ 1.36
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UBE2E3-202ENST00000410062 MPP5Q8N3R9 675 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3-202ENST00000410062 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3-202ENST00000410062 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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UBE2E3-202ENST00000410062 SERPINA9Q86WD7 417 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR156Q8NFN8 814 aa23.52■■□□□ 1.36
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UBE2E3-202ENST00000410062 KLC4Q9NSK0 619 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3-202ENST00000410062 EVA1BQ9NVM1 165 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3-202ENST00000410062 PADI4Q9UM07 663 aa23.52■■□□□ 1.36
UBE2E3-202ENST00000410062 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa23.52■■□□□ 1.36
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UBE2E3-202ENST00000410062 CASC4Q6P4E1 433 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM220Q6QAJ8 160 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 DHRS13Q6UX07 377 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 IFI44Q8TCB0 444 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 PATE1Q8WXA2 126 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 PEX13Q92968 403 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 DCUN1D1Q96GG9 259 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 COPS8Q99627 209 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 KIFC1Q9BW19 673 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 TREX1Q9NSU2 369 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa23.51■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 NCOR2Q9Y618 2525 aa23.51■■□□□ 1.35
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UBE2E3-202ENST00000410062 FNBP1LQ5T0N5 605 aa23.5■■□□□ 1.35
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UBE2E3-202ENST00000410062 C11orf96Q7Z7L8 435 aa23.5■■□□□ 1.35
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UBE2E3-202ENST00000410062 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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UBE2E3-202ENST00000410062 C14orf28Q4W4Y0 310 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 PERM1Q5SV97 790 aa23.49■■□□□ 1.35
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UBE2E3-202ENST00000410062 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 OR4L1Q8NH43 312 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 TIMM29Q9BSF4 260 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 ASXL3Q9C0F0 2248 aa23.49■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 SDR42E2A6NKP2 422 aa23.48■■□□□ 1.35
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UBE2E3-202ENST00000410062 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM16O95361 564 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 TUBB4AP04350 444 aa23.48■■□□□ 1.35
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UBE2E3-202ENST00000410062 ILKQ13418 452 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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UBE2E3-202ENST00000410062 SAMD15Q9P1V8 674 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa23.48■■□□□ 1.35
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UBE2E3-202ENST00000410062 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 RAD51CO43502 376 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 SGTAO43765 313 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 POP7O75817 140 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 CLDN6P56747 220 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 PRDM8Q9NQV8 689 aa23.48■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 RP1P56715 2156 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 CFAP99D6REC4 459 aa23.47■■□□□ 1.35
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