RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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RABGGTA-202ENST00000399409 SPPL2CQ8IUH8 684 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 MFSD2AQ8NA29 543 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 SMIM14Q96QK8 99 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF225Q9UK10 706 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAM12O43184 909 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 H6PDO95479 791 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 NPPAP01160 153 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 FCGR1AP12314 374 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 HK3P52790 923 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
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RABGGTA-202ENST00000399409 GPNMBQ14956 572 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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RABGGTA-202ENST00000399409 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 SUN2Q9UH99 717 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 AURKCQ9UQB9 309 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 DYTNA2CJ06 578 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM234BA2RU67 622 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 ARPC2O15144 300 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 FASP25445 335 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 CACNG1Q06432 222 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT80Q6KB66 452 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 MYO1HQ8N1T3 1032 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM199Q8N511 208 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 TSPAN14Q8NG11 270 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 GKN1Q9NS71 199 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC154A6NI56 674 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 C9JVG2 144 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 E2F3O00716 465 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 TSPAN3O60637 253 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 OR1D2P34982 312 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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RABGGTA-202ENST00000399409 CPNE9Q8IYJ1 553 aa22.85■■□□□ 1.25
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RABGGTA-202ENST00000399409 EGFL7Q9UHF1 273 aa22.85■■□□□ 1.25
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RABGGTA-202ENST00000399409 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 CKMT2P17540 419 aa22.84■■□□□ 1.25
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RABGGTA-202ENST00000399409 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 ADGRG5Q8IZF4 528 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 C9orf16Q9BUW7 83 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 LHX3Q9UBR4 397 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 DHRS7Q9Y394 339 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 H3BNH8 94 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 CD160O95971 181 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 C7P10643 843 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 UMPSP11172 480 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 GSK3BP49841 420 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
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RABGGTA-202ENST00000399409 CERS6Q6ZMG9 384 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC43Q8N309 656 aa22.84■■□□□ 1.25
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RABGGTA-202ENST00000399409 HM13Q8TCT9 377 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 TFAP2CQ92754 450 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 ALG2Q9H553 416 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 IL17CQ9P0M4 197 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 ASPDHA6ND91 283 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 SOCS2O14508 198 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 OR4F21O95013 312 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 CLCN7P51798 805 aa22.83■■□□□ 1.25
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