RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 FBXL22Q6P050 247 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 NOTUMQ6P988 496 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 ANO5Q75V66 913 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TTC30AQ86WT1 665 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 CAMK1DQ8IU85 385 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 C4orf19Q8IY42 314 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM255BQ8WV15 326 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC51Q96ER9 411 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM175Q9BSA9 504 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 B3GNT4Q9C0J1 378 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 ZBP1Q9H171 429 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF304Q9HCX3 659 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TBC1D13Q9NVG8 400 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 FRYLO94915 3013 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TPRP12270 2363 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 STK36Q9NRP7 1315 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM150BA6NC51 233 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 MCIDASD6RGH6 385 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 SLC16A5O15375 505 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 SLC37A4O43826 429 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 EDIL3O43854 480 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 PFKFB2O60825 505 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 STBD1O95210 358 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 URODP06132 367 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 KRT2P35908 639 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 STT3AP46977 705 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 SLC11A1P49279 550 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 CLCN5P51795 746 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 AK2P54819 239 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 DLX5P56178 289 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TRAF2Q12933 501 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 EMC2Q15006 297 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 ATG9BQ674R7 924 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF367Q7RTV3 350 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 C14orf80Q86SX3 495 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 RNF149Q8NC42 400 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 PRSS33Q8NF86 280 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 STAMQ92783 540 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM143Q96AN5 459 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 LXNQ9BS40 222 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 MFSD1Q9H3U5 465 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 POMKQ9H5K3 350 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 SPTBN2O15020 2390 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 FAM234BA2RU67 622 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 ARL5CA6NH57 179 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 MS4A18H0YCH9 400 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 LYPLA2O95372 231 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 EPCAMP16422 314 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 STAT1P42224 750 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 OR1G1P47890 313 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 PRIM2P49643 509 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 PTENP60484 403 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 CYP4A11Q02928 519 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TRIM29Q14134 588 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 PTPN14Q15678 1187 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 CALCRLQ16602 461 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 FSCBQ5H9T9 825 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 GPR65Q8IYL9 337 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 FAM185AQ8N0U4 392 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 TTC17Q96AE7 1141 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 RTP4Q96DX8 246 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 HES6Q96HZ4 224 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-204ENST00000367379 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms