RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 MYO10Q9HD67 2058 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 PSMD11O00231 422 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 GFRA2O00451 464 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 KCNN4O15554 427 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 MTSS1O43312 755 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 PSTPIP1O43586 416 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 UBOX5O94941 541 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ANPEPP15144 967 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ALOX12P18054 663 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SOX11P35716 441 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 HCAR3P49019 387 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SEC13P55735 322 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 MZT2AQ6P582 158 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 KRT74Q7RTS7 529 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SIK2Q9H0K1 926 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 AMFRQ9UKV5 643 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 CAPN8A6NHC0 703 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 APOA4P06727 396 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ITGB6P18564 788 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 TACR2P21452 398 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 GDI1P31150 447 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SLC6A4P31645 630 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 L1CAMP32004 1257 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 POU3F4P49335 361 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 DPYSL2Q16555 572 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 EML3Q32P44 896 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ATP2A3Q93084 1043 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SLC29A1Q99808 456 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 CCDC78A2IDD5 438 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 OR6C74A6NCV1 312 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 F5H5T6 163 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 RASGRF2O14827 1237 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 UNC5CO95185 931 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 NFATC1O95644 943 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 IDUAP35475 653 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 TDGQ13569 410 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 PDK2Q15119 407 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 MPPE1Q53F39 396 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 MPP7Q5T2T1 576 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 FBXL22Q6P050 247 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 IYDQ6PHW0 289 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 XKR5Q6UX68 686 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 CHSY1Q86X52 802 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 HPS6Q86YV9 775 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 IRF7Q92985 503 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-201ENST00000351328 OMA1Q96E52 524 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms