RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593586.1

TTC9B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

Gene TTC9B, Length 2,323 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-202ENST00000593586 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TTC9B-202ENST00000593586 PEAK1Q9H792 1746 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 PTPRCP08575 1304 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 NUTM2FA1L443 756 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 USP31Q70CQ4 1352 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 TTC22Q5TAA0 569 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 RAB3GAP1Q15042 981 aa25■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 CEP85Q6P2H3 762 aa25■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 RGPD1P0DJD0 1748 aa25■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 NALCNQ8IZF0 1738 aa25■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 ARXQ96QS3 562 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 MSH6P52701 1360 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 CRB1P82279 1406 aa24.98■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.98■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 RTL1A6NKG5 1358 aa24.98■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 GBP4Q96PP9 640 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 LTKP29376 864 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 ARHGEF10O15013 1369 aa24.96■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 SSH2Q76I76 1423 aa24.96■■□□□ 1.59
TTC9B-202ENST00000593586 MEIS3Q99687 375 aa24.95■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 SOX12O15370 315 aa24.95■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 SLC4A2P04920 1241 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 RABEP1Q15276 862 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 PTPRUQ92729 1446 aa24.92■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 MRE11P49959 708 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 FOXO3O43524 673 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 PANK2Q9BZ23 570 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 USP26Q9BXU7 913 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 PTMSP20962 102 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 SBNO1A3KN83 1393 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 SDSP20132 328 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 FLT4P35916 1363 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC9B-202ENST00000593586 APBB1O00213 710 aa24.89■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 KDRP35968 1356 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 HMMRO75330 724 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 CASC1Q6TDU7 716 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 G2E3Q7L622 706 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.86■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 SSFA2P28290 1259 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 EID1Q9Y6B2 187 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 F6X3S4 739 aa24.84■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.84■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.84■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 EYA1Q99502 592 aa24.84■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 AMPHP49418 695 aa24.83■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TTC9B-202ENST00000593586 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 REC8O95072 547 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 STK31Q9BXU1 1019 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 TBX22Q9Y458 520 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 GNAI2P04899 355 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 PDE1AP54750 535 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 DIP2AQ14689 1571 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 ERC2O15083 957 aa24.77■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.77■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 PIK3C2AO00443 1686 aa24.77■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 ST18O60284 1047 aa24.77■■□□□ 1.56
TTC9B-202ENST00000593586 SLIT1O75093 1534 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC9B-202ENST00000593586 NUCB2P80303 420 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC9B-202ENST00000593586 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TTC9B-202ENST00000593586 FLIIQ13045 1269 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC9B-202ENST00000593586 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC9B-202ENST00000593586 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC9B-202ENST00000593586 NLRP6P59044 892 aa24.74■■□□□ 1.55
TTC9B-202ENST00000593586 LRRC37A3O60309 1634 aa24.74■■□□□ 1.55
TTC9B-202ENST00000593586 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.74■■□□□ 1.55
TTC9B-202ENST00000593586 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms