RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PRR20EP86478 221 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PRR20CP86479 221 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PRR20DP86480 221 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PRR20BP86481 221 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PRR20AP86496 221 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 LAPTM4AQ15012 233 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 AFAP1Q8N556 730 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PTPRMP28827 1452 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 MAP3K1Q13233 1512 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 ATP10AO60312 1499 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 GDF9O60383 454 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 LYPD8Q6UX82 237 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 GOPCQ9HD26 462 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 GFRA3O60609 400 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 TNFRSF10AO00220 468 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 IL27Q8NEV9 243 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 TSC1Q92574 1164 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 MAP10Q9P2G4 905 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 A2MP01023 1474 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 MBD5Q9P267 1494 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 WNT7BP56706 349 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 KCNH2Q12809 1159 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 FOXC1Q12948 553 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 DEPDC5O75140 1603 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 STRCQ7RTU9 1775 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 WNT7AO00755 349 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 SKOR1P84550 965 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-204ENST00000558666 CTHP32929 405 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 Q6ZNB5 142 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 DAPK1P53355 1430 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 AGLP35573 1532 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 ITGAEP38570 1179 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 LCE2BO14633 110 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 RFC5P40937 340 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 SH3BP2P78314 561 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF511Q8NB15 262 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 E9PCH4 1651 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 UNC13BO14795 1591 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 LINC01559Q495D7 138 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 PIK3C2BO00750 1634 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 ABCC3O15438 1527 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 ABCC5O15440 1437 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 MIA2Q96PC5 1412 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 FAM187AA6NFU0 413 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD3-204ENST00000558666 AP1G2O75843 785 aa6.6□□□□□ -1.35
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