RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551634.5

NPAS3-211, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene NPAS3, Length 2,718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-211ENST00000551634 USP26Q9BXU7 913 aa29.2■■■□□ 2.27
NPAS3-211ENST00000551634 RGS12O14924 1447 aa29.2■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 DCTN1Q14203 1278 aa29.2■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 ITSN1Q15811 1721 aa29.2■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 PTPRCP08575 1304 aa29.19■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 CHL1O00533 1208 aa29.19■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 METP08581 1390 aa29.19■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 NUCB2P80303 420 aa29.18■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 KLHL40Q2TBA0 621 aa29.18■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 ESPNB1AK53 854 aa29.17■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 BAG4O95429 457 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 CEP85Q6P2H3 762 aa29.17■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 CASC1Q6TDU7 716 aa29.16■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.16■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.15■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 RTL1A6NKG5 1358 aa29.14■■■□□ 2.26
NPAS3-211ENST00000551634 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.13■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.11■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 SDSP20132 328 aa29.11■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 MSH6P52701 1360 aa29.1■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.1■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 REC8O95072 547 aa29.09■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 ST18O60284 1047 aa29.08■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 CCDC173Q0VFZ6 552 aa29.08■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 MLECQ14165 292 aa29.08■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.08■■■□□ 2.25
NPAS3-211ENST00000551634 HMMRO75330 724 aa29.07■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 KRT24Q2M2I5 525 aa29.07■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 PPP1R9BQ96SB3 815 aa29.07■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.06■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.06■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.06■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 OSBPL3Q9H4L5 887 aa29.06■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 MEIS3Q99687 375 aa29.05■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 ERBB4Q15303 1308 aa29.04■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.04■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 ZNF445P59923 1031 aa29.04■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 MCM10Q7L590 875 aa29.04■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 CRB1P82279 1406 aa29.04■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 NASPP49321 788 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa29.02■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 ERC2O15083 957 aa29.02■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
NPAS3-211ENST00000551634 AK9Q5TCS8 1911 aa29.01■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 SLC4A2P04920 1241 aa29.01■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 MCTP1Q6DN14 999 aa29.01■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.01■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 LMBRD1Q9NUN5 540 aa29■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 PLEKHG3A1L390 1219 aa29■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 CCT4P50991 539 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 USP31Q70CQ4 1352 aa29■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.98■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 ARHGEF10O15013 1369 aa28.98■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 ACEP12821 1306 aa28.97■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 PEAK1Q9H792 1746 aa28.97■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 USP6P35125 1406 aa28.96■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 PDE1AP54750 535 aa28.96■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.96■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 APBB1O00213 710 aa28.95■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.95■■■□□ 2.23
NPAS3-211ENST00000551634 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa28.93■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 MCM2P49736 904 aa28.92■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 PKP1Q13835 747 aa28.92■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 GNAI2P04899 355 aa28.92■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.92■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 ZSCAN30Q86W11 494 aa28.91■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.9■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 ZDHHC9Q9Y397 364 aa28.9■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 HS1BP3Q53T59 392 aa28.89■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 G2E3Q7L622 706 aa28.89■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.89■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 SSH2Q76I76 1423 aa28.89■■■□□ 2.22
NPAS3-211ENST00000551634 NCLP19338 710 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.89■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 KDRP35968 1356 aa28.89■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.88■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.88■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.87■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 TNRQ92752 1358 aa28.86■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 F6X3S4 739 aa28.86■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 GNAI3P08754 354 aa28.86■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 STK31Q9BXU1 1019 aa28.86■■■□□ 2.21
NPAS3-211ENST00000551634 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms