RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 MON2Q7Z3U7 1717 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 PTPRCP08575 1304 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 RGS12O14924 1447 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 REC8O95072 547 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 SDSP20132 328 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 CPS1P31327 1500 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 MSH6P52701 1360 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 KIAA0232Q92628 1395 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF445P59923 1031 aa11.58□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.58□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 RTL1A6NKG5 1358 aa11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 NRKQ7Z2Y5 1582 aa11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 CHL1O00533 1208 aa11.57□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 HMMRO75330 724 aa11.57□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.57□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 APBB1O00213 710 aa11.57□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 RRP9O43818 475 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 SULT6B1Q6IMI4 303 aa11.57□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 ZSCAN30Q86W11 494 aa11.57□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 C3P01024 1663 aa11.57□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.57□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 ERC2O15083 957 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 ITSN1Q15811 1721 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 KRT24Q2M2I5 525 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 MEIS3Q99687 375 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 AKAP12Q02952 1782 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 TPM2P07951 284 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 MCM10Q7L590 875 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 METP08581 1390 aa11.55□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.55□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.55□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 PKP1Q13835 747 aa11.55□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 AGLP35573 1532 aa11.54□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 SIRT1Q96EB6 747 aa11.54□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 AK9Q5TCS8 1911 aa11.54□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC4A2P04920 1241 aa11.54□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 HS1BP3Q53T59 392 aa11.54□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 OSBPL3Q9H4L5 887 aa11.54□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 TECPR2O15040 1411 aa11.53□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
RRN3P1-202ENST00000546471 MCM2P49736 904 aa11.52□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 PDE1AP54750 535 aa11.52□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 MCCP23508 829 aa11.52□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.52□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 CRB1P82279 1406 aa11.51□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa11.51□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 GPT2Q8TD30 523 aa11.51□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 RBSNQ9H1K0 784 aa11.51□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 ZDHHC9Q9Y397 364 aa11.51□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 PRR36Q9H6K5 1346 aa11.51□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa11.51□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 OFD1O75665 1012 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 MBD3O95983 291 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 GNAI2P04899 355 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 NEK4P51957 841 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 ARHGEF10O15013 1369 aa11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 TMX3Q96JJ7 454 aa11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 RGPD1P0DJD0 1748 aa11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 STK31Q9BXU1 1019 aa11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 LRRCC1Q9C099 1032 aa11.49□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 F6X3S4 739 aa11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 G2E3Q7L622 706 aa11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 ACEP12821 1306 aa11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 MX1P20591 662 aa11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 ANAPC15P60006 121 aa11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 MLECQ14165 292 aa11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 PEAK1Q9H792 1746 aa11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 MIS18AQ9NYP9 233 aa11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1-202ENST00000546471 SSH2Q76I76 1423 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms