RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 GNAI1P63096 354 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRD-214ENST00000540109 GPATCH11Q8N954 259 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRD-214ENST00000540109 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRD-214ENST00000540109 USP31Q70CQ4 1352 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRD-214ENST00000540109 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRD-214ENST00000540109 ESPNB1AK53 854 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRD-214ENST00000540109 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRD-214ENST00000540109 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 ZNF592Q92610 1267 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 PTPRUQ92729 1446 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 IFT57Q9NWB7 429 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGEF10O15013 1369 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 POLKQ9UBT6 870 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 KCNJ4P48050 445 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 BACH2Q9BYV9 841 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 RTL1A6NKG5 1358 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 FAM161AQ3B820 660 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 RIPK4P57078 832 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 MCM5P33992 734 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 CNPY4Q8N129 248 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 CTR9Q6PD62 1173 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 SSH2Q76I76 1423 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 SBNO1A3KN83 1393 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 IL13P35225 146 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 TERF1P54274 439 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 MVPQ14764 893 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 FLT4P35916 1363 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 RNF20Q5VTR2 975 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 CERS3Q8IU89 383 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 TPM4P67936 248 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 FAM193AP78312 1265 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA0232Q92628 1395 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 NEUROD2Q15784 382 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 ACEP12821 1306 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC34Q96HJ3 373 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 LTKP29376 864 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRD-214ENST00000540109 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 NME9Q86XW9 330 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 FAM107BQ9H098 131 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 NWD1Q149M9 1564 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-214ENST00000540109 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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