RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 MAP3K5Q99683 1374 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 STARD3NLO95772 234 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 CNTROBQ8N137 903 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 CRBNQ96SW2 442 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 USP6P35125 1406 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 TSPOAP1O95153 1857 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 KRT32Q14532 448 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 RABEP1Q15276 862 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 ADGRB2O60241 1585 aa7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 GORABQ5T7V8 394 aa7.12□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.12□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.12□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.12□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.12□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.12□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 PDCP20941 246 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 FGD1P98174 961 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 KIF1AQ12756 1690 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 ABCC6O95255 1503 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 CABP4P57796 275 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 CERS3Q8IU89 383 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 ADGRB1O14514 1584 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 IFT172Q9UG01 1749 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 NPHP1O15259 732 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 PDE4AP27815 886 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 FBXO3Q9UK99 471 aa7.11□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 RGS3P49796 1198 aa7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 TPM4P67936 248 aa7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 DCAF5Q96JK2 942 aa7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.1□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 PTPRMP28827 1452 aa7.09□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.09□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 POLKQ9UBT6 870 aa7.09□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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POLK-215ENST00000514141 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.09□□□□□ -1.27
POLK-215ENST00000514141 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 ATP10DQ9P241 1426 aa7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 RAD50Q92878 1312 aa7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 BTBD11A6QL63 1104 aa7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 COG6Q9Y2V7 657 aa7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 RGL2O15211 777 aa7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 IL13P35225 146 aa7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 ANAPC15P60006 121 aa7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 NME9Q86XW9 330 aa7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 TRDNQ13061 729 aa7.06□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 MBD3O95983 291 aa7.06□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 TPM3P06753 285 aa7.06□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 SLF2Q8IX21 1173 aa7.06□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.06□□□□□ -1.28
POLK-215ENST00000514141 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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