RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 HS1BP3Q53T59 392 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.41■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 TERF1P54274 439 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 MCTP1Q6DN14 999 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.4■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TSPYL6Q8N831 410 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 GNAI1P63096 354 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 IFT57Q9NWB7 429 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 FAM83GA6ND36 823 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 DCTN1Q14203 1278 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 LTKP29376 864 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 CPS1P31327 1500 aa18.38■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TTC22Q5TAA0 569 aa18.37■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.37■□□□□ 0.53
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TOP3B-206ENST00000436282 USP26Q9BXU7 913 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
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TOP3B-206ENST00000436282 MBIPQ9NS73 344 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF853P0CG23 659 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 DCTPP1Q9H773 170 aa18.36■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 AEBP1Q8IUX7 1158 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 RBSNQ9H1K0 784 aa18.35■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ACEP12821 1306 aa18.34■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SIRT1Q96EB6 747 aa18.34■□□□□ 0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.33■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.33■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PKP1Q13835 747 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ST18O60284 1047 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.32■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TECPR2O15040 1411 aa18.31■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 CASC1Q6TDU7 716 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 GPT2Q8TD30 523 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 EID1Q9Y6B2 187 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.3■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.29■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.29■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ATP10DQ9P241 1426 aa18.29■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 MAP7D2Q96T17 732 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 SDSP20132 328 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 MCM5P33992 734 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3B-206ENST00000436282 KRT24Q2M2I5 525 aa18.27■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 REC8O95072 547 aa18.26■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MCM10Q7L590 875 aa18.26■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.26■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.25■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.24■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHG3A1L390 1219 aa18.24■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.24■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 CEP85Q6P2H3 762 aa18.24■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MBD3O95983 291 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRUQ92729 1446 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 UQCRHLA0A096LP55 91 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 SYCE3A1L190 88 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 UQCRHP07919 91 aa18.23■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RGS12O14924 1447 aa18.22■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 ERC2O15083 957 aa18.22■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.22■□□□□ 0.51
TOP3B-206ENST00000436282 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.21■□□□□ 0.51
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