RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
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TTLL3-210ENST00000427220 SDSP20132 328 aa24.32■■□□□ 1.48
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TTLL3-210ENST00000427220 PANK2Q9BZ23 570 aa24.25■■□□□ 1.47
TTLL3-210ENST00000427220 RTL1A6NKG5 1358 aa24.25■■□□□ 1.47
TTLL3-210ENST00000427220 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
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TTLL3-210ENST00000427220 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
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TTLL3-210ENST00000427220 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
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TTLL3-210ENST00000427220 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.22■■□□□ 1.47
TTLL3-210ENST00000427220 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TTLL3-210ENST00000427220 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.22■■□□□ 1.47
TTLL3-210ENST00000427220 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TTLL3-210ENST00000427220 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TTLL3-210ENST00000427220 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TTLL3-210ENST00000427220 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
TTLL3-210ENST00000427220 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.2■■□□□ 1.46
TTLL3-210ENST00000427220 PTPRCP08575 1304 aa24.2■■□□□ 1.46
TTLL3-210ENST00000427220 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.19■■□□□ 1.46
TTLL3-210ENST00000427220 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.18■■□□□ 1.46
TTLL3-210ENST00000427220 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.18■■□□□ 1.46
TTLL3-210ENST00000427220 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.18■■□□□ 1.46
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