RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHG5O94827 1062 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 GRPEL1Q9HAV7 217 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 MSH6P52701 1360 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM2Q9UHN6 1383 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 BAG4O95429 457 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP6R1Q9UPN7 881 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 PALD1Q9ULE6 856 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 SLIT1O75093 1534 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3C2AO00443 1686 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 UBR1Q8IWV7 1749 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 GPT2Q8TD30 523 aa4.56□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP3K19Q56UN5 1328 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 ITPRIPQ8IWB1 547 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf115Q9H7X2 142 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 GLI3P10071 1580 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 LMTK3Q96Q04 1460 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 BRD1O95696 1058 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 ST3GAL1Q11201 340 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 STAP2Q9UGK3 403 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 SDSP20132 328 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 BECN1Q14457 450 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 MEIS3Q99687 375 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC61Q9Y6R9 512 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM63CQ9P1W3 806 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 GNAI1P63096 354 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNB2Q92953 911 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF10O15013 1369 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 G2E3Q7L622 706 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 FUCA2Q9BTY2 467 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 NFAT5O94916 1531 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 DCTN1Q14203 1278 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC5CLQ8IV45 518 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 LTKP29376 864 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRKQ9NRH2 765 aa4.54□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 PXDNLA1KZ92 1463 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 TERF1P54274 439 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 HS1BP3Q53T59 392 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 OSCARQ8IYS5 282 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 RBSNQ9H1K0 784 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 OFD1O75665 1012 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 JCADQ9P266 1359 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 HMOX1P09601 288 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE1AP54750 535 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC14Q96N46 770 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 USP44Q9H0E7 712 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 MTX1Q13505 466 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXO3O43524 673 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC45O75419 566 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 POLA2Q14181 598 aa4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PGGT1B-203ENST00000419445 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM87AQ8NBN3 555 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RABEP1Q15276 862 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX11L8A8MPP1 907 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SSH3Q8TE77 659 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 STK26Q9P289 416 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ADCY9O60503 1353 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 KAZALD1Q96I82 304 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RASEFQ8IZ41 740 aa4.52□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 LMO7Q8WWI1 1683 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MRC1P22897 1456 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PI4K2BQ8TCG2 481 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 AP5Z1O43299 807 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM94Q12767 1356 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 AK9Q5TCS8 1911 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 IL17REQ8NFR9 667 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
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