RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF853P0CG23 659 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NLRP6P59044 892 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PIK3R4Q99570 1358 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ORAI2Q96SN7 254 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX21Q969T3 373 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCC4O15439 1325 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 DCTN1Q14203 1278 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP44Q96MT7 982 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ABTB2Q8N961 1025 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FSD2A1L4K1 749 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 DDIT3P35638 169 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF2CQ99661 725 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXO3O43524 673 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PANK2Q9BZ23 570 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PEAK1Q9H792 1746 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SSH2Q76I76 1423 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PIK3C2AO00443 1686 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 AMPHP49418 695 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PSME1Q06323 249 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC45O75419 566 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT24Q2M2I5 525 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 GBP4Q96PP9 640 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 MRE11P49959 708 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 DCTPP1Q9H773 170 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1-202ENST00000417536 MCM10Q7L590 875 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 USP31Q70CQ4 1352 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 APBB1O00213 710 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC22Q5TAA0 569 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 EYA1Q99502 592 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM94Q12767 1356 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 SSFA2P28290 1259 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 CHL1O00533 1208 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP85Q6P2H3 762 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP10DQ9P241 1426 aa23.08■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXC9P31274 260 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 FLT4P35916 1363 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MSH6P52701 1360 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS12O14924 1447 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MEIS3Q99687 375 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SBNO1A3KN83 1393 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 RTL1A6NKG5 1358 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 RABEP1Q15276 862 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 USP26Q9BXU7 913 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
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