RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366578.5

ACTN2-201, Transcript of actinin alpha 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN2, Length 4,863 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2-201ENST00000366578 RAD21O60216 631 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTN2-201ENST00000366578 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTN2-201ENST00000366578 SKAP1Q86WV1 359 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTN2-201ENST00000366578 CEP89Q96ST8 783 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTN2-201ENST00000366578 TRPM2O94759 1503 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTN2-201ENST00000366578 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTN2-201ENST00000366578 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTN2-201ENST00000366578 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.83□□□□□ -0.03
ACTN2-201ENST00000366578 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.83□□□□□ -0.03
ACTN2-201ENST00000366578 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 FAM177BA6PVY3 158 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 BICD2Q8TD16 824 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 KLHL34Q8N239 644 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 NGLY1Q96IV0 654 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 KRT32Q14532 448 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 MCM10Q7L590 875 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 ZPR1O75312 459 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 MAPKBP1O60336 1514 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 ZFYVE9O95405 1425 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 AACSQ86V21 672 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 NEK4P51957 841 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 A0A087WZG4 1122 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 FYB1O15117 783 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTN2-201ENST00000366578 MBD3O95983 291 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 FLT4P35916 1363 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 PIK3R4Q99570 1358 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 NPATQ14207 1427 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 JMYQ8N9B5 988 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 SIL1Q9H173 461 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 ADAMTS2O95450 1211 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 CDKL5O76039 1030 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 ABCC1P33527 1531 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 TXLNAP40222 546 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 METTL24Q5JXM2 366 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 FLIIQ13045 1269 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 PZPP20742 1482 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 PIK3C2GO75747 1445 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 DCTN1Q14203 1278 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 MYD88Q99836 296 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 TRAK2O60296 914 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTN2-201ENST00000366578 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTN2-201ENST00000366578 SLF2Q8IX21 1173 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms