RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		3.04	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		3.04	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		3.04	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		3.04	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	GLOD5	A6NK44	160 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	HS3ST1	O14792	307 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ADAMDEC1	O15204	470 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ADAM20	O43506	726 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PLPP2	O43688	288 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CSPG5	O95196	566 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ADRB2	P07550	413 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	HLA-DOB	P13765	273 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MMP9	P14780	707 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	AKR1B1	P15121	316 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	IL11	P20809	199 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CCKBR	P32239	447 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	NNMT	P40261	264 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ART1	P52961	327 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SLC20A2	Q08357	652 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SNTA1	Q13424	505 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	KCNC3	Q14003	757 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	KCTD2	Q14681	263 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	NTRK2	Q16620	822 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC190	Q86UF4	302 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	AACS	Q86V21	672 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	KBTBD6	Q86V97	674 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM219	Q86XT9	240 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CEP97	Q8IW35	865 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MOAP1	Q96BY2	351 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	RTP4	Q96DX8	246 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM19	Q96HH6	336 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ADGRG7	Q96K78	797 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	QRFPR	Q96P65	431 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SLC22A12	Q96S37	553 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	KLHL1	Q9NR64	748 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC72	A6NJI9	287 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	C4orf47	A7E2U8	309 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF217	O75362	1048 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	STARD3NL	O95772	234 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	GH2	P01242	217 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	T-ENOL	P0DO92	83 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	MYOD1	P15172	320 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	KCNA5	P22460	613 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	HRH2	P25021	359 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	PDE1B	Q01064	536 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	DLG2	Q15700	870 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	KIF19	Q2TAC6	998 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	TRNP1	Q6NT89	227 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	GPR180	Q86V85	440 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	EMC1	Q8N766	993 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		3.02	□□□□□ -1.93

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