RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A0G2JNG1 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 P4HA2O15460 535 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 MAN1A2O60476 641 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 SNX2O60749 519 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 UBXN7O94888 489 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 EBLN1P0CF75 366 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 VIPR1P32241 457 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 SCNN1AP37088 669 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 KIR3DL1P43629 444 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 CAPZBP47756 277 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 GABRB2P47870 512 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 ART1P52961 327 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 RRADP55042 308 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 ATP11AP98196 1134 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 APBA1Q02410 837 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 DPTQ07507 201 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 MYBPC3Q14896 1274 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 KIR2DS5Q14953 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 CDSNQ15517 529 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 KYNUQ16719 465 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 C2CD6Q53TS8 623 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 VWA2Q5GFL6 755 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 DCAF10Q5QP82 559 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM26Q6ZUK4 368 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 TSPAN33Q86UF1 283 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 CCDC185Q8N715 623 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 FAR1Q8WVX9 515 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 C14orf79Q96F83 325 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 ABCG8Q9H221 673 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 SYNCQ9H7C4 482 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 PDE7BQ9NP56 450 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 FGF21Q9NSA1 209 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM51Q9NW97 253 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 CD84Q9UIB8 345 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 SNX7Q9UNH6 387 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 COL6A5A8TX70 2615 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM221AA4D161 298 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 WASH4PA8MWX3 477 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 ACP5P13686 325 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 AMD1P17707 334 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 USP8P40818 1118 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 GPR1P46091 355 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 KCNK10P57789 538 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 BCL2L1Q07817 233 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 DSELQ8IZU8 1212 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 GALNT16Q8N428 558 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 EMC1Q8N766 993 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 SHC3Q92529 594 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 SCAMP4Q969E2 229 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 SGSM3Q96HU1 749 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 NLNQ9BYT8 704 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 LRRC19Q9H756 370 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 ATRQ13535 2644 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 SPTBP11277 2137 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1W2PQJ5 194 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 PSMD11O00231 422 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 MEN1O00255 615 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-217ENST00000580654 PRAMEF11O60813 436 aa7.53□□□□□ -1.2
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