RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	UBE4B	O95155	1302 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CETN3	O15182	167 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CLDN3	O15551	220 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TOM1L1	O75674	476 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	POLB	P06746	335 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ADRB2	P07550	413 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GHR	P10912	638 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TGM2	P21980	687 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SCP2	P22307	547 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PRPH2	P23942	346 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ITGB8	P26012	769 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CD38	P28907	300 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	AVPR2	P30518	371 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CD52	P31358	61 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ACOT2	P49753	483 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CYP2J2	P51589	502 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	OSTN	P61366	133 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	LPIN1	Q14693	890 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	KRT31	Q15323	416 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NFIL3	Q16649	462 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	BICD1	Q96G01	975 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934		M0QZ92	97 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MASP2	O00187	686 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	EXTL3	O43909	919 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	FAM189A1	O60320	539 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ERLIN2	O94905	339 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	GNA14	O95837	355 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CELA2A	P08217	269 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CD63	P08962	238 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CAPN2	P17655	700 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CERS1	P27544	350 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ABCD1	P33897	745 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	PNPLA4	P41247	253 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	TNFSF9	P41273	254 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	ADPRH	P54922	357 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LINS1-210	ENST00000560934	CCL23	P55773	120 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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