RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRK1Q38SD2 2015 aa17.08■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIOO75962 3097 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A087X1B8 175 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRR23AA6NEV1 266 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGAP14A8MT82 685 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 ESR1P03372 595 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 GSTA1P08263 222 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 GM2AP17900 193 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 FDXRP22570 491 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR4P57081 412 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAS2R38P59533 333 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 INSCQ1MX18 579 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTSL3PQ5NE16 218 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANO7Q6IWH7 933 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIM3Q86V86 326 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARMC2Q8NEN0 867 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM131CQ96AQ9 280 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CENPTQ96BT3 561 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 HHIPQ96QV1 700 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 C2orf42Q9NWW7 574 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 COMMD10Q9Y6G5 202 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR91A4D1P6 747 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 NIPSNAP2O75323 286 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 VPS26AO75436 327 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TM7SF2O76062 418 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 PYGLP06737 847 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKT1P31749 480 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 NSG1P42857 185 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TPMTP51580 245 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADARP55265 1226 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTAPQ13126 283 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP2U1Q7Z449 544 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM124AQ86V42 546 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 NAT14Q8WUY8 206 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCTD4Q8WVF5 259 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCYL1Q96KG9 808 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 P2RY12Q9H244 342 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM216Q9P0N5 145 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNPTGQ9UJJ9 305 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLXNA2O75051 1894 aa17.07■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGLON5A6NGN9 336 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 IQCF5A8MTL0 148 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 FADS2P1A8MWK0 482 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASMTLO95671 621 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 APBB3O95704 486 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC166P0CW27 439 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEFHP12036 1026 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSRP3P50461 194 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADPRHP54922 357 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSHL1Q14406 222 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 ITIH4Q14624 930 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPRC6AQ5T6X5 926 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAET1GQ6H3X3 334 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA6LQ8N4H0 392 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLDN19Q8N6F1 224 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 DTX3LQ8TDB6 740 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 NXNL1Q96CM4 212 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCUN1D1Q96GG9 259 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 ITM2CQ9NQX7 267 aa17.06■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D3EA0A087X179 549 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D3LB9A6J9 549 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 RRP9O43818 475 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D3HP0C7X1 549 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL6A2P12110 1019 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR1P46091 355 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLRBP48167 497 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLEC14AQ86T13 490 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPNS2Q8IVW8 549 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAMKK1Q8N5S9 505 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR21Q99679 349 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 BTBD1Q9H0C5 482 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 KDM4CQ9H3R0 1056 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 PREBQ9HCU5 417 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCTD5Q9NXV2 234 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRSS21Q9Y6M0 314 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFAP99D6REC4 459 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 INPP4BO15327 924 aa17.05■□□□□ 0.32
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTX2O75431 263 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms