RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 A0A0G2JNG1 304 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 OR5K4A6NMS3 321 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 DUX1O43812 170 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 SLC4A1P02730 911 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 GPR89BP0CG08 455 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 PLA2G2AP14555 144 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 SLC2A4P14672 509 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 NFKB1P19838 968 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 KIR2DS5Q14953 304 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 BMPERQ8N8U9 685 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 EXD3Q8N9H8 876 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 NCSTNQ92542 709 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 P3H4Q92791 437 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 ART4Q93070 314 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 BPIFA1Q9NP55 256 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 BSNQ9UPA5 3926 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 PRR19A6NJB7 356 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 EFCAB7A8K855 629 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 A8MU76 341 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 B4E171 279 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 STMND1H3BQB6 276 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 KMOO15229 486 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 MTX2O75431 263 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 HMGCLP35914 325 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 TSPAN7P41732 249 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 EPHA4P54764 986 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 WNT3AP56704 352 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 NOMO1Q15155 1222 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 PID1Q7Z2X4 250 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 ZNF567Q8N184 647 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 NKD1Q969G9 470 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 MED8Q96G25 268 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 VPS35Q96QK1 796 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 FCRL5Q96RD9 977 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 DDA1Q9BW61 102 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 TRIM5Q9C035 493 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 KALRNO60229 2985 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.27□□□□□ -0.12
CS-229ENST00000551936 MTSS1O43312 755 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 VEGFDO43915 354 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 CDK14O94921 469 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 EPOP01588 193 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 UGT1A3P35503 534 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 SLC19A1P41440 591 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 MARCKSL1P49006 195 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 MC2RQ01718 297 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 INSCQ1MX18 579 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 SLC25A41Q8N5S1 370 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 KRT35Q92764 455 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 HAUS1Q96CS2 278 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 VAT1Q99536 393 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 SPRY4Q9C004 299 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 ZMYND15Q9H091 742 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 TRABDQ9H4I3 376 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 IL17CQ9P0M4 197 aa14.27□□□□□ -0.13
CS-229ENST00000551936 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms