RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 UGT1A5P35504 534 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ATP12AP54707 1039 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 NAGLUP54802 743 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ADGRF1Q5T601 910 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 STK32CQ86UX6 486 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 GDF3Q9NR23 364 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CD207Q9UJ71 328 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CDH7Q9ULB5 785 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 WNT7AO00755 349 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 MMP20O60882 483 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 C8GP07360 202 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SYPP08247 313 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 MLIPQ5VWP3 458 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SLC51AQ86UW1 340 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SETD9Q8NE22 299 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 C19orf18Q8NEA5 215 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA22Q8NHS9 363 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 MIOSQ9NXC5 875 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 OR10H3O60404 316 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 LGALS3BPQ08380 585 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 KLHL12Q53G59 568 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 WDR93Q6P2C0 686 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZVU0 165 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SVOPQ8N4V2 548 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RNF148Q8N7C7 305 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RIT1Q92963 219 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TLR10Q9BXR5 811 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ARL5AQ9Y689 179 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 A6NCN8 305 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 FCHO1O14526 889 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 F2P00734 622 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 HLA-EP13747 358 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SEPHS1P49903 392 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 GTF2H2Q13888 395 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PIK3R6Q5UE93 754 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 EPS8L2Q9H6S3 715 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 FANCFQ9NPI8 374 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 DUOX1Q9NRD9 1551 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 EPHB6O15197 1021 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SIN3BO75182 1162 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 HNMTP50135 292 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 FAM153CQ494X1 144 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 OFCC1Q8IZS5 231 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TNFRSF25Q93038 417 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CDRT15Q96T59 188 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SCML2Q9UQR0 700 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 AKAP12Q02952 1782 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CCL22O00626 93 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 FUT2Q10981 343 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJB14Q8TBM8 379 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 C19orf60Q96EN9 201 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 VPS35Q96QK1 796 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PNPLA8Q9NP80 782 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 UGT2B17O75795 530 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 IFNGP01579 166 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RANBP1P43487 201 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 IZUMO1Q8IYV9 350 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TBATAQ96M53 351 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 DLGAP3O95886 979 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RB1P06400 928 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1606.2 ms