RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517070.1

RN7SKP98-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 98, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP98, Length 156 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP98-201ENST00000517070 ISL1P61371 349 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 EMX2Q04743 252 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 LIPEQ05469 1076 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 CD47Q08722 323 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 SPP2Q13103 211 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 SLC13A2Q13183 592 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 SEMA3BQ13214 749 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 ORC1Q13415 861 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 GPR50Q13585 617 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 GRM3Q14832 879 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 CLCA4Q14CN2 919 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 GEN1Q17RS7 908 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 SMU1Q2TAY7 513 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 CNSTQ6PJW8 725 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 BRINP3Q76B58 766 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 GALNT7Q86SF2 657 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 CUZD1Q86UP6 607 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 STK32CQ86UX6 486 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 CPXCR1Q8N123 301 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 NATD1Q8N6N6 113 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 NDNFQ8TB73 568 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 FRS2Q8WU20 508 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 TMBIM1Q969X1 311 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 CPB2Q96IY4 423 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 RNF170Q96K19 258 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 LRRC3Q9BY71 257 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 NUAK2Q9H093 628 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 PORCNQ9H237 461 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 NTN4Q9HB63 628 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 IL37Q9NZH6 218 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 XPR1Q9UBH6 696 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.9□□□□□ -1.3
RN7SKP98-201ENST00000517070 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 FAM92AA1XBS5 289 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 PRSS47A8MTI9 375 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 A8MU76 341 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 M0QYV0 167 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 TOR1BO14657 336 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 NRP1O14786 923 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 RGS10O43665 173 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 TPST1O60507 370 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 SNX2O60749 519 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 LILRB3O75022 631 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 CILPO75339 1184 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 ANGPTL1O95841 491 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 F9P00740 461 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 PGK2P07205 417 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 PAMP19021 973 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 HLA-DMAP28067 261 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 PSMB4P28070 264 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 PTGS2P35354 604 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 SOX6P35712 828 aa6.89□□□□□ -1.31
RN7SKP98-201ENST00000517070 ARL2P36404 184 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms