RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 TEKT5Q96M29 485 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TAS2R3Q9NYW6 316 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GDE1Q9NZC3 331 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 WHRNQ9P202 907 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC3P53804 2025 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMA4Q16363 1823 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C5orf60A6NFR6 353 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM210A6NLX4 147 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C2orf74A8MZ97 194 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 VILLO15195 856 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOC3O60645 756 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PAPLNO95428 1278 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FTCDO95954 541 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PLATP00750 562 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRKCBP05771 671 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT8P05787 483 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 STSP08842 583 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 UMPSP11172 480 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MAOBP27338 520 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TYK2P29597 1187 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PITPNBP48739 271 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GLO1Q04760 184 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf72Q14CZ0 275 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SV2BQ7L1I2 683 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NUDT13Q86X67 352 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS58Q8IYP2 241 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC2A14Q8TDB8 520 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TCP10LQ8TDR4 215 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PTP4A1Q93096 173 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM63Q969Q1 353 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MS4A3Q96HJ5 214 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CYTH2Q99418 400 aa4.55□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC4A5Q9BY07 1137 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SMYD3Q9H7B4 428 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FBRSQ9HAH7 460 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 USP29Q9HBJ7 922 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CMTM6Q9NX76 183 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PLCL2Q9UPR0 1127 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GDAQ9Y2T3 454 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DTNAQ9Y4J8 743 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MYH7BA7E2Y1 1941 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.55□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM23A6NLE4 172 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 K7ERI5 159 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF263O14978 683 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF862O60290 1169 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CDK14O94921 469 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CLEC2LP0C7M8 214 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMP2P13473 410 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NR4A1P22736 598 aa4.55□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 STAT5AP42229 794 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MAPK8P45983 427 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 EPHB3P54753 998 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ARPP19P56211 112 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RAC3P60763 192 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS26P62854 115 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MADCAM1Q13477 382 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TUSC1Q2TAM9 212 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 IER5LQ5T953 404 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ARSKQ6UWY0 536 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CATSPER1Q8NEC5 780 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DNASE1L2Q92874 299 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf21Q9H246 121 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OR51B6Q9H340 312 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.55□□□□□ -1.68
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