RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 RUNX1T1Q06455 604 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 CDONQ4KMG0 1287 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 SIRPB2Q5JXA9 342 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 FRG2Q64ET8 278 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 PMS2CLQ68D20 193 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 NFE4Q86UQ8 179 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 PERPQ96FX8 193 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 NEURL4Q96JN8 1562 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 JMJD4Q9H9V9 463 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 PREBQ9HCU5 417 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 HECW1Q76N89 1606 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 KDM5DQ9BY66 1539 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-206ENST00000467748 DVL1O14640 695 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CD53P19397 219 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 AMPHP49418 695 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 F2RL1P55085 397 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF234Q14588 700 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 C18orf63Q68DL7 685 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 OR52I2Q8NH67 350 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 METTL6Q8TCB7 284 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 QRFPRQ96P65 431 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 SMC6Q96SB8 1091 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC1Q9BTT6 524 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 MYO3AQ8NEV4 1616 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 AGLP35573 1532 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 EP400Q96L91 3159 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CTAGE9A4FU28 777 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 PLEKHD1A6NEE1 506 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNHIT1O43257 154 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 PAGE4O60829 102 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CTAGE8P0CG41 777 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ANOS1P23352 680 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 PBX3P40426 434 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 RARSP54136 660 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CASP6P55212 293 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 HILS1P60008 231 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CDC16Q13042 620 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 OLIG2Q13516 323 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 DECR1Q16698 335 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 DCST1Q5T197 706 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 TTI2Q6NXR4 508 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR180Q86V85 440 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CTAGE4Q8IX94 777 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 TAAR8Q969N4 342 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXO17Q96EF6 278 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 LINGO1Q96FE5 620 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 NEUROD6Q96NK8 337 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 WDFY2Q96P53 400 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 TAS2R10Q9NYW0 307 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 A2ML1A8K2U0 1454 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 MED14O60244 1454 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 RALGAPBQ86X10 1494 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1W2PQF6 199 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 M0QZ24 198 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CGAP01215 116 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 OLR1P78380 273 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 SREBF2Q12772 1141 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 GRIK2Q13002 908 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CCNG2Q16589 344 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ADSSL1Q8N142 457 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 SMARCE1Q969G3 411 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 HARBI1Q96MB7 349 aa3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.6 ms