RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 DPH5Q9H2P9 285 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 CHRAC1Q9NRG0 131 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJC28Q9NX36 388 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 KLQ9UEF7 1012 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 KLK13Q9UKR3 277 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 CACNA1EQ15878 2313 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 H3BM21 787 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SH3BP5O60239 455 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 RASGRP1O95267 797 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF1O95521 474 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFP01375 233 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 CSF2P04141 144 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 NME1P15531 152 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ITGALP20701 1170 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 CCT8P50990 548 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 CRADDP78560 199 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR33Q49SQ1 333 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 CASC4Q6P4E1 433 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SNX20Q7Z614 316 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 NAXDQ8IW45 347 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 PDIK1LQ8N165 341 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 OR13J1Q8NGT2 312 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ULK4Q96C45 1275 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 TBATAQ96M53 351 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ASB8Q9H765 288 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SMOXQ9NWM0 555 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 DGKBQ9Y6T7 804 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SCN8AQ9UQD0 1980 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC78A2IDD5 438 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM202A6NGA9 273 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT1A9O60656 530 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 CEACAM5P06731 702 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 JUNDP17535 347 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT1A6P19224 532 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT1A1P22309 533 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT1A4P22310 534 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 MC4RP32245 332 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT1A3P35503 534 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT1A5P35504 534 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL4CP56559 192 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC7A5Q01650 507 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 NFATC2Q13469 925 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 PEX6Q13608 980 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ALG11Q2TAA5 492 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 HSP90B2PQ58FF3 399 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 LDLRAP1Q5SW96 308 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 HDAC10Q969S8 669 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SIGLEC10Q96LC7 697 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF778Q96MU6 729 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 RMI1Q9H9A7 625 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 VIPAS39Q9H9C1 493 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT1A7Q9HAW7 530 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT1A10Q9HAW8 530 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 UGT1A8Q9HAW9 530 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 IL21RQ9HBE5 538 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 TREX1Q9NSU2 369 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 AGAP14A8MT82 685 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR89AB7ZAQ6 455 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 CCL22O00626 93 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 TP73O15350 636 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHGA12O60330 932 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ASMTLO95671 621 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR89BP0CG08 455 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 PAMP19021 973 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 NMBRP28336 390 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ARSDP51689 593 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 HK3P52790 923 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEP78395 509 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 CACNG1Q06432 222 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 HIF1AQ16665 826 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF542PQ5EBM4 170 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 DOK6Q6PKX4 331 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 AFTPHQ6ULP2 937 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 GLRX5Q86SX6 157 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM74Q86UV6 250 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 HID1Q8IV36 788 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 PHACTR4Q8IZ21 702 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 MPP5Q8N3R9 675 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 GDAP1Q8TB36 358 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms