RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 BIRC2Q13490 618 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 STRADBQ9C0K7 418 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 THSD1Q9NS62 852 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNK6Q9Y257 313 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PKP3Q9Y446 797 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 A6NCN8 305 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CPNE6O95741 557 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 IYDQ6PHW0 289 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
UBE2E3-201ENST00000392415 CDRT15L2A8MXV6 281 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PLD2O14939 933 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 MTX2O75431 263 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK14O94921 469 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 F3P13726 295 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ITPKBP27987 946 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CD1CP29017 333 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCG1P45844 678 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SQSTM1Q13501 440 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 OLIG2Q13516 323 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CHRNA6Q15825 494 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 AMZ1Q400G9 498 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PIM3Q86V86 326 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 APOL2Q9BQE5 337 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 RDH14Q9HBH5 336 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 KMOO15229 486 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TNFSF15O95150 251 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGA2BP08514 1039 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PARP6Q2NL67 630 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP9Q49MG5 647 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 USP53Q70EK8 1073 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRTM4Q86VH4 590 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF547Q8IVP9 402 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 KLC4Q9NSK0 619 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC23A2Q9UGH3 650 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ARL5AQ9Y689 179 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PRR19A6NJB7 356 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 OR5K4A6NMS3 321 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 C2orf81A6NN90 581 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 UGT1A9O60656 530 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC175P0C221 793 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC2A4P14672 509 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 UGT1A6P19224 532 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 UGT1A1P22309 533 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 UGT1A4P22310 534 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 UGT1A3P35503 534 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 UGT1A5P35504 534 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGA9Q13797 1035 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRCAPQ14761 206 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 KCTD11Q693B1 232 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CLEC14AQ86T13 490 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 GDAP1Q8TB36 358 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM159Q96B96 161 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 NUDT22Q9BRQ3 303 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TIMM29Q9BSF4 260 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 SEMA6CQ9H3T2 930 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2E3-201ENST00000392415 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms