RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388948.7

LRRK1-201, Transcript of leucine rich repeat kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene LRRK1, Length 7,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1-201ENST00000388948 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 CCNA2P20248 432 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ZBTB6Q15916 424 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 IL17AQ16552 155 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ARSHQ5FYA8 562 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 CMTM6Q9NX76 183 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 H7C0S8 307 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 FZD9O00144 591 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 TGFB1I1O43294 461 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 LRIG2O94898 1065 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 DGCR6Q14129 220 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 GRB14Q14449 540 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 RNF186Q9NXI6 227 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 MED26O95402 600 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 SCTRP47872 440 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 BAP1Q92560 729 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 IDO1P14902 403 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 OMPP47874 163 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 RBBP4Q09028 425 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 CARD16Q5EG05 197 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 NDC1Q9BTX1 674 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 VSTM5A8MXK1 200 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 LAMTOR5O43504 91 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 CLDN9O95484 217 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 NDST2P52849 883 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 NRG3P56975 720 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 C1QTNF8P60827 252 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 TRPV3Q8NET8 790 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 TBATAQ96M53 351 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.76□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ADGRB1O14514 1584 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 AQP1P29972 269 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 FANCFQ9NPI8 374 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 AK5Q9Y6K8 562 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 KAT6AQ92794 2004 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 WNT9AO14904 365 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 CCNCP24863 283 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ZNF366Q8N895 744 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 RIT1Q92963 219 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 GRIN2DO15399 1336 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 OR5F1O95221 314 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ASMTP46597 345 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 MARCKSL1P49006 195 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 GINS4Q9BRT9 223 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 PLA2G16P53816 162 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ENKURQ8TC29 256 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 CREBZFQ9NS37 354 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 PDP2Q9P2J9 529 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 FAM153BP0C7A2 387 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 PRR5P85299 388 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 TEAD2Q15562 447 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 FAM153CQ494X1 144 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 RDH11Q8TC12 318 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 PIGKQ92643 395 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 RHOJQ9H4E5 214 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 TXNDC8Q6A555 127 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 MBOAT7Q96N66 472 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 SH3GL3Q99963 347 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 GBA3Q9H227 469 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 COPG2Q9UBF2 871 aa14.75□□□□□ -0.05
LRRK1-201ENST00000388948 SIN3BO75182 1162 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms