RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346562.6

NPAS3-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPAS3, Length 5,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-201ENST00000346562 ZBTB6Q15916 424 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 VPS26BQ4G0F5 336 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 DUPD1Q68J44 220 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 MOB2Q70IA6 237 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 HERVK_113Q902F9 699 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 FATE1Q969F0 183 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 FRMD6Q96NE9 622 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 CALML5Q9NZT1 146 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 UBXN7O94888 489 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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NPAS3-201ENST00000346562 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.95■■□□□ 1.26
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NPAS3-201ENST00000346562 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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NPAS3-201ENST00000346562 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 PCBD2Q9H0N5 130 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 OSER1Q9NX31 292 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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NPAS3-201ENST00000346562 SULT1C3Q6IMI6 304 aa22.95■■□□□ 1.26
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NPAS3-201ENST00000346562 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 OR4Q2P0C623 313 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 SLC7A2P52569 658 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 RASSF5Q8WWW0 418 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 KLRG1Q96E93 195 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 A0A0X1KG70 313 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 KLRC4O43908 158 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 PLOD3O60568 738 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 STK16O75716 305 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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NPAS3-201ENST00000346562 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 TSSK3Q96PN8 268 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 MARCKSL1P49006 195 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 STX12Q86Y82 276 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 LCN9Q8WX39 176 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 PNPOQ9NVS9 261 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.94■■□□□ 1.26
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NPAS3-201ENST00000346562 PADI3Q9ULW8 664 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 AP5Z1O43299 807 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 ENPEPQ07075 957 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 C5orf22Q49AR2 442 aa22.93■■□□□ 1.26
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NPAS3-201ENST00000346562 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 PLGRKTQ9HBL7 147 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 PACSIN3Q9UKS6 424 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 CILPO75339 1184 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 BICRALQ6AI39 1079 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 XAGE5Q8WWM1 108 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 PLEKHA1Q9HB21 404 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 EGFL7Q9UHF1 273 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 SNX7Q9UNH6 387 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa22.93■■□□□ 1.26
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NPAS3-201ENST00000346562 S100A9P06702 114 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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NPAS3-201ENST00000346562 XIAPP98170 497 aa22.93■■□□□ 1.26
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NPAS3-201ENST00000346562 ITGB5P18084 799 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 CRHR1P34998 444 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 CDH13P55290 713 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 SNAPC1Q16533 368 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 FAM131AQ6UXB0 335 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 AMIGO2Q86SJ2 522 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 CERS5Q8N5B7 392 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 NPAS2Q99743 824 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NPAS3-201ENST00000346562 CD84Q9UIB8 345 aa22.93■■□□□ 1.26
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