RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 LCHNA4D1U4 455 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 KDELR3O43731 214 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 FAM58BPP0C7Q3 252 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 IRF1P10914 325 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 LBPP18428 481 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 UGT1A6P19224 532 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 PHEXP78562 749 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RAD51Q06609 339 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RPS6KA2Q15349 733 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 NADK2Q4G0N4 442 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 GRAMD4Q6IC98 578 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 VPS33AQ96AX1 596 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ROPN1LQ96C74 230 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 HSPBAP1Q96EW2 488 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 IQCF5A8MTL0 148 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ANGPT2O15123 496 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 COCHO43405 550 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFB5O43674 189 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CRCPO75575 148 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CES1P23141 567 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CDH4P55283 916 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ANKS6Q68DC2 871 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SYVN1Q86TM6 617 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 AHI1Q8N157 1196 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 DHRS1Q96LJ7 313 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CMTM6Q9NX76 183 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RAI2Q9Y5P3 530 aa16.24■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TNFAIP8O95379 198 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 GALTP07902 379 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 MC4RP32245 332 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RPL5P46777 297 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SLC11A2P49281 568 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 HK3P52790 923 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SLC52A3Q9NQ40 469 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RIMKLBQ9ULI2 386 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 AURKCQ9UQB9 309 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PQY0 241 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 FAM149AA5PLN7 773 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 C2orf81A6NN90 581 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 VILLO15195 856 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SNAP91O60641 907 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TSPAN12O95859 305 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RHOCP08134 193 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CTSL3PQ5NE16 218 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 OR2T34Q8NGX1 318 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 OR2T3Q8NH03 318 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 PBXIP1Q96AQ6 731 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF597Q96LX8 424 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 PLOD2O00469 737 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 AKAP10O43572 662 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TPST1O60507 370 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 F11P03951 625 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RPS17P08708 135 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 BMP1P13497 986 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 PSMC3P17980 439 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SLC6A2P23975 617 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 HSPA13P48723 471 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 GSTM4Q03013 218 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CDK15Q96Q40 435 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 TTPALQ9BTX7 342 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf50Q9BV19 199 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RNF38Q9H0F5 515 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF696Q9H7X3 374 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 GPR45Q9Y5Y3 372 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 SOCS2O14508 198 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 PRAMEF12O95522 483 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 IFNEQ86WN2 208 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.22■□□□□ 0.19
SHQ1-201ENST00000325599 OR2T11Q8NH01 316 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms