RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248550.7

PHTF2-201, Transcript of putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PHTF2, Length 4,778 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2-201ENST00000248550 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 FBXL20Q96IG2 436 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 TGM7Q96PF1 710 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 MED18Q9BUE0 208 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 KLHL4Q9C0H6 718 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 SPATA7Q9P0W8 599 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 FAM90A27PA6NNH2 459 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 M0QZ24 198 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 MYO1FO00160 1098 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 PI15O43692 258 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 WNT11O96014 354 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 UGT2B4P06133 528 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 GSTT2P0CG29 244 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 GSTT2BP0CG30 244 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 ZNF28P17035 718 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 ATP6V1C1P21283 382 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 NR2F2P24468 414 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 PSMA2P25787 234 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 PTGS2P35354 604 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 RARRES1P49788 294 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 SLC5A3P53794 718 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 PMS2P54278 862 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 GAB1Q13480 694 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 NRF1Q16656 503 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 CRB2Q5IJ48 1285 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 TMEM270Q6UE05 265 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 RUFY3Q7L099 469 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 KIAA1328Q86T90 577 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 LINC00523Q86TU6 105 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 SLC26A11Q86WA9 606 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 MAP4K3Q8IVH8 894 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 FBXO30Q8TB52 745 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 HMCESQ96FZ2 354 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 EGFL8Q99944 293 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 LPIN3Q9BQK8 851 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 LHPPQ9H008 270 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 TSPY26PQ9H489 355 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 POT1Q9NUX5 634 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 HSPBP1Q9NZL4 362 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 ESYT3A0FGR9 886 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 ILVBLA1L0T0 632 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 H0Y3Z8 333 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 MID1O15344 667 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 AKR1B10O60218 316 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 CHEK2O96017 543 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 PPP3CBP16298 524 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 LHCGRP22888 699 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 CD86P42081 329 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 LIMS1P48059 325 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 PRKAG1P54619 331 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 RAD23AP54725 363 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 KIAA1024LP59773 190 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 MBTD1Q05BQ5 628 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 ENPEPQ07075 957 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 MAPK7Q13164 816 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 EFR3AQ14156 821 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 SETDB1Q15047 1291 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 TBR1Q16650 682 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 RAP1GAP2Q684P5 730 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 ZNF677Q86XU0 584 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 NUP37Q8NFH4 326 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 RAD54LQ92698 747 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 ANKRD27Q96NW4 1050 aa3.5□□□□□ -1.85
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PHTF2-201ENST00000248550 SMOC1Q9H4F8 434 aa3.5□□□□□ -1.85
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PHTF2-201ENST00000248550 IL21RQ9HBE5 538 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 ABCF3Q9NUQ8 709 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 VTI1BQ9UEU0 232 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 MYH7P12883 1935 aa3.5□□□□□ -1.85
PHTF2-201ENST00000248550 A0A1W2PP18 115 aa3.5□□□□□ -1.85
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