RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A0U1RQS6 177 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SYCE1LA8MT33 242 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PRRT4C9JH25 899 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 MATN2O00339 956 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 FCHO1O14526 889 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 HDAC3O15379 428 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ZBTB14O43829 449 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 BNIP3LO60238 219 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 KLK8O60259 260 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 OR1I1O60431 355 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SMIM24O75264 130 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 LEFTY1O75610 366 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TSPAN12O95859 305 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PRNPP04156 253 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 C1SP09871 688 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 T-ENOLP0DO92 83 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 KITP10721 976 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 LHCGRP22888 699 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINB3P29508 390 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNC1P48547 511 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SPINT3P49223 89 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 RASSF2P50749 326 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CLCN7P51798 805 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TUBB3Q13509 450 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CHRNA6Q15825 494 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CFAP157Q5JU67 520 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 VITQ6UXI7 678 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 DPPA4Q7L190 304 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TMIEQ8NEW7 156 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CD200R1Q8TD46 325 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 UCMAQ8WVF2 138 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SORCS1Q8WY21 1168 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PPM1EQ8WY54 764 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PTERQ96BW5 349 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ASB2Q96Q27 587 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM237Q96Q45 408 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR21Q99679 349 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CLPBQ9H078 707 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 S1PR5Q9H228 398 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 LRMDAQ9H2I8 198 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 EBF3Q9H4W6 596 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 POMKQ9H5K3 350 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 IGFLR1Q9H665 355 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ALG9Q9H6U8 611 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM50BQ9Y247 325 aa9.45□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CAPN14A8MX76 684 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 E5RI56 91 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PSMD11O00231 422 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 RFXAPO00287 272 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 STX16O14662 325 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 NIPSNAP2O75323 286 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ECI2O75521 394 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CHRNGP07510 517 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CTSLP07711 333 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 BMP1P13497 986 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 MTHFD2P13995 350 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PSMC3P17980 439 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CHRM3P20309 590 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNA5P22460 613 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 NSG1P42857 185 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC6A11P48066 632 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 LIG3P49916 1009 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 IL2P60568 153 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 HERVK_113P63132 956 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 RUNX3Q13761 415 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ARHGEF7Q14155 803 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 E2F5Q15329 346 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CES5AQ6NT32 575 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TDHQ8IZJ6 230 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TERB1Q8NA31 727 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR26Q8NDV2 337 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 NXPE3Q969Y0 559 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SGF29Q96ES7 293 aa9.44□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 NSL1Q96IY1 281 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms