RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 AP2M1Q96CW1 435 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 MRGPRX1Q96LB2 322 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC13A1Q9BZW2 595 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCG8Q9H221 673 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RY12Q9H244 342 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ACOT9Q9Y305 439 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 KRBA1A5PL33 1030 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BMM5 538 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ACADMP11310 421 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT1A6P19224 532 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT1A1P22309 533 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT1A4P22310 534 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 FDXRP22570 491 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TARSP26639 723 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT1A3P35503 534 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT1A5P35504 534 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC26A3P40879 764 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 NSG1P42857 185 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 DGKEP52429 567 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM92Q6UXU6 159 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 MDM1Q8TC05 714 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 NUS1Q96E22 293 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 BIRC8Q96P09 236 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 NDNQ99608 321 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CLPBQ9H078 707 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS11Q9H270 941 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM4CQ9H3R0 1056 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 LMAN1LQ9HAT1 526 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R13Q9NYV9 303 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CD84Q9UIB8 345 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 PLLPQ9Y342 182 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 DOCK9Q9BZ29 2069 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP20O60882 483 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 PYGLP06737 847 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 SAT1P21673 171 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC14AQ86T13 490 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CACUL1Q86Y37 369 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 PNPLA1Q8N8W4 532 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD42Q8N9B4 389 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 GANCQ8TET4 914 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 SCAMP4Q969E2 229 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TSNARE1Q96NA8 513 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 COPS8Q99627 209 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPS2Q9BXY5 557 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35E2BP0CK96 405 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 FMO4P31512 558 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 NEK5Q6P3R8 708 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP97Q8IW35 865 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ9Q92806 393 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 OLFM1Q99784 485 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 OSBPL6Q9BZF3 934 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 SERGEFQ9UGK8 458 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 GNPTGQ9UJJ9 305 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR39O43194 453 aa30.76■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TM7SF2O76062 418 aa30.76■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 PREBQ9HCU5 417 aa30.76■■■□□ 2.52
CAPNS1-206ENST00000588815 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1I1O60431 355 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS26AO75436 327 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDH8O95206 1070 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 CBX1P83916 185 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 UBXN2BQ14CS0 331 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 PPM1JQ5JR12 505 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 LDLRAP1Q5SW96 308 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT3A1Q6NUS8 523 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 DDHD1Q8NEL9 900 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 GPAMQ9HCL2 828 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP99D6REC4 459 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 F8W8V4 182 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 ASMTLO95671 621 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFV2P19404 249 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 CDKN2DP55273 166 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS21P63220 83 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP7D1Q3KQU3 841 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC153Q494R4 210 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZS52 159 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SIX5Q8N196 739 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 BTN2A2Q8WVV5 523 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SYTL2Q9HCH5 934 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 NUMA1Q14980 2115 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 RHOBTB1O94844 696 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 RALBP11234 206 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 GABRG2P18507 467 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 ETV4P43268 484 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 IL9RQ01113 521 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 GUCY1A3Q02108 690 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-206ENST00000588815 FZD5Q13467 585 aa30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms