RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	KNL1	Q8NG31	2342 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0D9SEW6	157 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1B0GVM2	712 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM72C	H0Y354	149 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	DFFA	O00273	331 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR42	O15529	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SNAP91	O60641	907 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MFAP3L	O75121	409 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	DNTT	P04053	509 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	GABRG2	P18507	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MIP	P30301	263 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PLA2G5	P39877	138 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	NBL1	P41271	181 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PSMD8	P48556	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	HDAC4	P56524	1084 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TPI1	P60174	286 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	OGDH	Q02218	1023 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	GNA12	Q03113	381 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ITK	Q08881	620 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MGAT5	Q09328	741 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	DLG2	Q15700	870 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ELF2	Q15723	593 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FUT11	Q495W5	492 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ARC	Q7LC44	396 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM72B	Q86X60	149 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CFHR4	Q92496	578 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PIGK	Q92643	395 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	MYLK	Q15746	1914 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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