RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549655.5

BRF1-215, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-215	ENST00000549655	TSPAN12	O95859	305 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	SPAM1	P38567	509 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	IL2	P60568	153 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	GEN1	Q17RS7	908 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	LRRC66	Q68CR7	880 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	TTC1	Q99614	292 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CLPB	Q9H078	707 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	BTN3A1	O00481	513 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	SUPT3H	O75486	399 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	GFAP	P14136	432 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	UGT1A6	P19224	532 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	UGT1A1	P22309	533 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	UGT1A4	P22310	534 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	UGT1A3	P35503	534 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	UGT1A5	P35504	534 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CLCN7	P51798	805 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	SHH	Q15465	462 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CHRNA6	Q15825	494 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	LINGO1	Q96FE5	620 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	ASIC4	Q96FT7	647 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	FAR2	Q96K12	515 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	BOC	Q9BWV1	1114 aa		18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	ECI2	O75521	394 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CYP17A1	P05093	508 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	TSPAN8	P19075	237 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	VIPR2	P41587	438 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	NRIP1	P48552	1158 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	NXN	Q6DKJ4	435 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	PLPP6	Q8IY26	295 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	RBFA	Q8N0V3	343 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	GPR26	Q8NDV2	337 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	FBXO10	Q9UK96	956 aa		18.98	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	SYCE1L	A8MT33	242 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	WASH3P	C4AMC7	463 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	ADH5	P11766	374 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	LHCGR	P22888	699 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	ACRV1	P26436	265 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	PBX2	P40425	430 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	MNAT1	P51948	309 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CDH13	P55290	713 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	MXRA7	P84157	204 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	PTS	Q03393	145 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	FRS2	Q8WU20	508 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	NAT14	Q8WUY8	206 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	BRD9	Q9H8M2	597 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	DHRS7	Q9Y394	339 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	TTC34	A8MYJ7	566 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	SDHD	O14521	159 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	NNMT	P40261	264 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	COPA	P53621	1224 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	PTPN5	P54829	565 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	BTK	Q06187	659 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	KLF10	Q13118	480 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	NAA25	Q14CX7	972 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	DUSP6	Q16828	381 aa		18.97	■□□□□ 0.63
BRF1-215	ENST00000549655	GPR33	Q49SQ1	333 aa		18.97	■□□□□ 0.63

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