RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	STK26	Q9P289	416 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	DLC1	Q96QB1	1528 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	JRK	O75564	520 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	RGS11	O94810	467 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	FTCD	O95954	541 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	TFPI	P10646	304 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	IFNAR1	P17181	557 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	TFAP4	Q01664	338 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	CXCL9	Q07325	125 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	STIM1	Q13586	685 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ALCAM	Q13740	583 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	COG2	Q14746	738 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	VMP1	Q96GC9	406 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	FLT1	P17948	1338 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0G2JK05	382 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	VCY	O14598	125 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	OGG1	O15527	345 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC7A4	O43246	635 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	TPO	P07202	933 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNC3	Q14003	757 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms