RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540900.7

NSRP1-206, Transcript of nuclear speckle splicing regulatory protein 1, human

TSL 5

Gene NSRP1, Length 2,057 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSRP1-206	ENST00000540900	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PAGE1	O75459	146 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ALPL	P05186	524 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	HRH2	P25021	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	EPS8	Q12929	822 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	DAG1	Q14118	895 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PLCL1	Q15111	1095 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	RABL3	Q5HYI8	236 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	MUS81	Q96NY9	551 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CHID1	Q9BWS9	393 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	UPK1A	O00322	258 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PEX11B	O96011	259 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CRHBP	P24387	322 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PCSK1	P29120	753 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CCR1	P32246	355 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	RENBP	P51606	427 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CLC	Q05315	142 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PCSK7	Q16549	785 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	XKR7	Q5GH72	579 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PIM3	Q86V86	326 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	DPP10	Q8N608	796 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	SLC35B4	Q969S0	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ING2	Q9H160	280 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CCDC154	A6NI56	674 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PPP6C	O00743	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	KERA	O60938	352 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ADAM23	O75077	832 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	LINC00032	P0C843	101 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	THRB	P10828	461 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	SLC2A3	P11169	496 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	NCK1	P16333	377 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	BDNF	P23560	247 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ELK4	P28324	431 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	HAL	P42357	657 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	DIO3	P55073	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	OR4D1	Q15615	310 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PFKFB4	Q16877	469 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TTC23	Q5W5X9	447 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	IFNE	Q86WN2	208 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	TADA1	Q96BN2	335 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	ZNF599	Q96NL3	588 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	MRO	Q9BYG7	248 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	LHPP	Q9H008	270 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	FAM234B	A2RU67	622 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900		J3QRK9	145 aa		13.52	□□□□□ -0.24
NSRP1-206	ENST00000540900	SLC22A3	O75751	556 aa		13.52	□□□□□ -0.24

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