RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 MAP7D1Q3KQU3 841 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM259Q4ZIN3 620 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 NLRP8Q86W28 1048 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 RBFAQ8N0V3 343 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 DCLK2Q8N568 766 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 COPS8Q99627 209 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 SLC39A10Q9ULF5 831 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 TRPM6Q9BX84 2022 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 AGAP14A8MT82 685 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 AKT1P31749 480 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 SLC12A2P55011 1212 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 FGL2Q14314 439 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 AGERQ15109 404 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 WSCD2Q2TBF2 565 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 TTMPQ5BVD1 217 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 BTN2A2Q8WVV5 523 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 GLYATL1Q969I3 302 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 DCUN1D1Q96GG9 259 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 NDNQ99608 321 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 GPR174Q9BXC1 333 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 CLPBQ9H078 707 aa21.86■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 LRRK1Q38SD2 2015 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 K7ESM1 405 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 AXIN1O15169 862 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 NDUFS2O75306 463 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 PYGLP06737 847 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 GPRC6AQ5T6X5 926 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 PNCKQ6P2M8 343 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 TRIM69Q86WT6 500 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 PELI3Q8N2H9 469 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 LPGAT1Q92604 370 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 VPS35Q96QK1 796 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 GPR22Q99680 433 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 MCMBPQ9BTE3 642 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 BOCQ9BWV1 1114 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 SMOXQ9NWM0 555 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 INVSQ9Y283 1065 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 NUMA1Q14980 2115 aa21.85■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1W2PPM1 405 aa21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 HMX2A2RU54 273 aa21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 K7ESF4 209 aa21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 RALBP11234 206 aa21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 MSH3P20585 1137 aa21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 LDLRAP1Q5SW96 308 aa21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 FRMD1Q8N878 549 aa21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 PLA2G15Q8NCC3 412 aa21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa21.84■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 CFAP99D6REC4 459 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 LAMTOR5O43504 91 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 MTX2O75431 263 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 FSBPO95073 299 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 TYK2P29597 1187 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 NSG1P42857 185 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 DNAJC3Q13217 504 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 ITIH4Q14624 930 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 IRF4Q15306 451 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 TRABD2AQ86V40 505 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 SPACA7Q96KW9 195 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 MYOCQ99972 504 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 CAB39LQ9H9S4 337 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 FZD3Q9NPG1 666 aa21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA8RI6L899 631 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 SOD1P00441 154 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 POLD2P49005 469 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 SERPINB8P50452 374 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 INPP5AQ14642 412 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 KIAA0895LQ68EN5 471 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 FAM45BPQ6NSW5 357 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 RAPH1Q70E73 1250 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 ACVR1CQ8NER5 493 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 FAM45AQ8TCE6 357 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 MZB1Q8WU39 189 aa21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PSPC1-204ENST00000492741 SENP1Q9P0U3 644 aa21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms