RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	BOLA3	Q53S33	107 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	DPPA4	Q7L190	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	NUS1	Q96E22	293 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PEBP4	Q96S96	227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TCF4	P15884	667 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	IL1R2	P27930	398 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	EPHB2	P29323	1055 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	RGR	P47804	291 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	MAP7	Q14244	749 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	DOK6	Q6PKX4	331 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SRL	Q86TD4	932 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	NCSTN	Q92542	709 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TEX101	Q9BY14	249 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ZWILCH	Q9H900	591 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0U1RQJ8	604 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	INPP4B	O15327	924 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	MAP3K6	O95382	1288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC175	P0C221	793 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	RARA	P10276	462 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF28	P17035	718 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SLC1A1	P43005	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	MAPK9	P45984	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	FASLG	P48023	281 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CDK3	Q00526	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CA9	Q16790	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PARP15	Q460N3	678 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	DENND2C	Q68D51	928 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TEKT4	Q8WW24	435 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ALG6	Q9Y672	507 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344		J3KR12	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CREB3	O43889	395 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	IVL	P07476	585 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	COMT	P21964	271 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TAS2R40	P59535	323 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	BCL2L1	Q07817	233 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	FOXM1	Q08050	763 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	NFATC2	Q13469	925 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	HSPH1	Q92598	858 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	OR2M4	Q96R27	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PDF	Q9HBH1	243 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	APC	P25054	2843 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RBM3-208	ENST00000489344	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-208	ENST00000489344	KRT86	O43790	486 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-208	ENST00000489344	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-208	ENST00000489344	HTR7	P34969	479 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-208	ENST00000489344	PGD	P52209	483 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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