RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 KYQ8NBH2 561 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 CDK15Q96Q40 435 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 PSKH2Q96QS6 385 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 IL12RB2Q99665 862 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 GNPTGQ9UJJ9 305 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRVP-201ENST00000482597 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 GDI1P31150 447 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 RFC2P35250 354 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 AP1S1P61966 158 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 IRF8Q02556 426 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 PRKG2Q13237 762 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 C16orf89Q6UX73 402 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 ECSITQ9BQ95 431 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 PARVBQ9HBI1 364 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 LCHNA4D1U4 455 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF487B1APH4 448 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC31A1O15431 190 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6ZVL8 140 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 RELL1Q8IUW5 271 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 IRF7Q92985 503 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 NRBF2Q96F24 287 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 FAR2Q96K12 515 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 KIFC1Q9BW19 673 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 KLHL25Q9H0H3 589 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 CDH19Q9H159 772 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 GGA2Q9UJY4 613 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 CDC7O00311 574 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 NFATC1O95644 943 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 ANXA5P08758 320 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 CES1P23141 567 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 SPAM1P38567 509 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 GJA8P48165 433 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 SGSHP51688 502 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM135Q86UB9 458 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP97Q8IW35 865 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAJB14Q8TBM8 379 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 SELENOMQ8WWX9 145 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 OR8D1Q8WZ84 308 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 RCN3Q96D15 328 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 DACH2Q96NX9 599 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 NPAS2Q99743 824 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 PEX1O43933 1283 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 DLX3O60479 287 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 LRATO95237 230 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 IRS1P35568 1242 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 GDF5P43026 501 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 SULT2A1Q06520 285 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAF2Q12933 501 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 TAZQ16635 292 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 RNF220Q5VTB9 566 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM74Q86UV6 250 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 NT5C3BQ969T7 300 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 FOCADQ5VW36 1801 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 MRASO14807 208 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 AZIN1O14977 448 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT75O95678 551 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP2A7P20853 494 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms