RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TRAF2Q12933 501 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TFDP2Q14188 446 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CLCA4Q14CN2 919 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ACOX1Q15067 660 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PDK1Q15118 436 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SLC9A4Q6AI14 798 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PNCKQ6P2M8 343 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 DPPA4Q7L190 304 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ATCAYQ86WG3 371 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 KRT35Q92764 455 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 HDAC11Q96DB2 347 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZPBPQ9BS86 351 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 EPN3Q9H201 632 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 NBASA2RRP1 2371 aa11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TEX15Q9BXT5 2789 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CTAGE9A4FU28 777 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZNF487B1APH4 448 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 FANCGO15287 622 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 B4GAT1O43505 415 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.555e-12■□□□□ 8.8
PRAME-210ENST00000442481 JCHAINP01591 159 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TUBB4AP04350 444 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 HLA-DQB2P05538 268 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CTPS1P17812 591 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CDKN2BP42772 138 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 EPHB1P54762 984 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 OR1D5P58170 312 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 FOXK1P85037 733 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SQSTM1Q13501 440 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 LIPIQ6XZB0 460 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 KATNAL2Q8IYT4 538 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 RCOR2Q8IZ40 523 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 FAM26EQ8N5C1 309 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ECHDC3Q96DC8 303 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 NUS1Q96E22 293 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SLC45A3Q96JT2 553 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 NSMCE3Q96MG7 304 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 HEMGNQ9BXL5 484 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SLC39A1Q9NY26 324 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SDK2Q58EX2 2172 aa11.6□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 GOLGA6CA6NDK9 693 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 GOLGA6BA6NDN3 693 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PSMD11O00231 422 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 DUX1O43812 170 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 RAD1O60671 282 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 SOCS5O75159 536 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PYGLP06737 847 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 GOLGA6DP0CG33 693 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 THRAP10827 490 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CCL4P13236 92 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 LIFP15018 202 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CR2P20023 1033 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CTNNA2P26232 953 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TEAD1P28347 426 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 RALGDSQ12967 914 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB17Q13105 803 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 RPS6KA1Q15418 735 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 CEACAM20Q6UY09 585 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 USP45Q70EL2 814 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 VSIG1Q86XK7 387 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-210ENST00000442481 FAM129CQ86XR2 697 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms