RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CDC42EP1Q00587 391 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 OVGP1Q12889 678 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 DUSP4Q13115 394 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 ADAM15Q13444 863 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 NAB1Q13506 487 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CARTPTQ16568 116 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 FAM187BQ17R55 369 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 GTDC1Q4AE62 458 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 SYCE2Q6PIF2 218 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 PALM2Q8IXS6 379 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 WDR48Q8TAF3 677 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 URGCPQ8TCY9 931 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 ST8SIA2Q92186 375 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 APOPT1Q96IL0 206 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 PWWP2AQ96N64 755 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 NANOGQ9H9S0 305 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CXorf21Q9HAI6 301 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CYP4F11Q9HBI6 524 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 TBX20Q9UMR3 447 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 DBX1A6NMT0 343 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CENPXA8MT69 81 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 A8MUA0 341 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CYP26A1O43174 497 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 ZBTB14O43829 449 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 MMP8P22894 467 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 OPRL1P41146 370 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CAPZA2P47755 286 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CPA2P48052 419 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 SOX9P48436 509 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 MARCKSL1P49006 195 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 NDST1P52848 882 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 ZBTB16Q05516 673 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 TRAF2Q12933 501 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CCNIQ14094 377 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 DUSP6Q16828 381 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 GJB7Q6PEY0 223 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 OR52N1Q8NH53 320 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 RFFLQ8WZ73 363 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 MSLNLQ96KJ4 702 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 PARVAQ9NVD7 372 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 GLTPQ9NZD2 209 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.21□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 PLOD2O00469 737 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 DAB1O75553 588 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 GCNT3O95395 438 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 CHRNB2P17787 502 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 UQCRC1P31930 480 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 LIMK1P53667 647 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ABRQ12979 859 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 KCNC3Q14003 757 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 UGP2Q16851 508 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 CCDC142Q17RM4 750 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 DCUN1D2Q6PH85 259 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 TMEM65Q6PI78 240 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.21□□□□□ -1.26
CCR6-202ENST00000349984 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms