RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 GDPD4Q6W3E5 623 aa26.61■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 FRS2Q8WU20 508 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa26.61■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 FAR2Q96K12 515 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 NUF2Q9BZD4 464 aa26.61■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 CCDC189A1A4V9 331 aa26.61■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 TSPAN12O95859 305 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 CISD3P0C7P0 127 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 VIPR2P41587 438 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 VASPP50552 380 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 GPR33Q49SQ1 333 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 TCEAL5Q5H9L2 206 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 RNF112Q9ULX5 631 aa26.61■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 KCNC3Q14003 757 aa26.6■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 CUZD1Q86UP6 607 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 TEX9Q8N6V9 391 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 SORCS1Q8WY21 1168 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 ASIC4Q96FT7 647 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 KLHL32Q96NJ5 620 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 HEPHQ9BQS7 1158 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC28BQ9BUN5 200 aa26.6■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 LINGO1Q96FE5 620 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 CRLS1Q9UJA2 301 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 GNPTGQ9UJJ9 305 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa26.59■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 SYCE1LA8MT33 242 aa26.59■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 TMEM233B4DJY2 109 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA8NF8WBI6 632 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 NEMP1O14524 444 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 SUPT7LO94864 414 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 ASLP04424 464 aa26.59■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 TSNQ15631 228 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 SUPT3HB4E1H0 165 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 CDC7O00311 574 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 SUPT3HO75486 399 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 ATP6V1G2O95670 118 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 GFAPP14136 432 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 FSHRP23945 695 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 EPHA3P29320 983 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 KDSRQ06136 332 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 PFKFB4Q16877 469 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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