RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 EML3Q32P44 896 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CHST14Q8NCH0 376 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 STON2Q8WXE9 905 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 KIAA1191Q96A73 305 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PHF21BQ96EK2 531 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 L3HYPDHQ96EM0 354 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ASB8Q9H765 288 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GALPQ9UBC7 116 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GRID2O43424 1007 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CISD3P0C7P0 127 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ITGALP20701 1170 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SPAM1P38567 509 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 VIPR2P41587 438 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 NFATC2Q13469 925 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 FRS2Q8WU20 508 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 MYLIPQ8WY64 445 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TTC1Q99614 292 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 KLC4Q9NSK0 619 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 A8MX80 341 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ADH1CP00326 375 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 NNMTP40261 264 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 DGKGP49619 791 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 KDM1BQ8NB78 822 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CD200R1Q8TD46 325 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SLC30A3Q99726 388 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PBX4Q9BYU1 374 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 MGRN1O60291 552 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 KERAO60938 352 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 AOC1P19801 751 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CHRM3P20309 590 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.854e-6■■■■■ 40.4
CTU2-210ENST00000567949 ARHGAP8P85298 464 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ZNF678Q5SXM1 525 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 LRRC66Q68CR7 880 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 UGT3A1Q6NUS8 523 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 PACS2Q86VP3 889 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 ASB16Q96NS5 453 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 BRD9Q9H8M2 597 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-210ENST00000567949 E5RI56 91 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 ENO1P06733 434 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 MTHFD2P13995 350 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 FSHRP23945 695 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 HERVK_113P63132 956 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 CHRNA6Q15825 494 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 GPR33Q49SQ1 333 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 ASIC4Q96FT7 647 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 TRMOQ9BU70 441 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.33■□□□□ 0.84
CTU2-210ENST00000567949 TAGLN3Q9UI15 199 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms