RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM72BQ86X60 149 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFT20Q8IY31 132 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF461Q8TAF7 563 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MDM1Q8TC05 714 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACTL9Q8TC94 416 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 POF1BQ8WVV4 589 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASB10Q8WXI3 467 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 P3H4Q92791 437 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 NT5C3BQ969T7 300 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SERPINB11Q96P15 392 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLHL5Q96PQ7 755 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CSPG4P5Q96PW8 444 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF157Q96PX1 679 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF670Q9BS34 389 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 NACA2Q9H009 215 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SIK2Q9H0K1 926 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB17Q9H0T7 212 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMOC2Q9H3U7 446 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRC19Q9H756 370 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRPC7Q9HCX4 862 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ETNK2Q9NVF9 386 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASIC3Q9UHC3 531 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 FBXW11Q9UKB1 542 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB21Q9UL25 225 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 NFU1Q9UMS0 254 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF148Q9UQR1 794 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNX24Q9Y343 169 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 HELZP42694 1942 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 DENND4CQ5VZ89 1909 aa5.6□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 I6L893 689 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 GRM6O15303 877 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCL16O15467 120 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MFSD11O43934 449 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TLR5O60602 858 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPDEFO95238 335 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 GAS8O95995 478 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 GLUD1P00367 558 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFNB1P01574 187 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGLV3-25P01717 112 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRT14P02533 472 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 APOEP02649 317 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 APOC2P02655 101 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CSH1P0DML2 217 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CSH2P0DML3 217 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TGM2P21980 687 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL4RP24394 825 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CTSSP25774 331 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CD38P28907 300 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCR1P32246 355 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPL21P46778 160 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CXCR3P49682 368 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 VCPP55072 806 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TBX4P57082 545 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 GBE1Q04446 702 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTK6Q13882 451 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 NOMO1Q15155 1222 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAZQ16635 292 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP9Q49MG5 647 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 WDR93Q6P2C0 686 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PQLC3Q8N755 202 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLD5Q8N7P1 536 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATL2Q8NHH9 583 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPPL3Q8TCT6 385 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 RUBCNQ92622 972 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TFAP2CQ92754 450 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 NTAN1Q96AB6 310 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERP44Q9BS26 406 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM121Q9BTD3 319 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 NEUROG2Q9H2A3 272 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIF1Q9H611 641 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARFGAP3Q9NP61 516 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 GDF3Q9NR23 364 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM114A2Q9NRY5 505 aa5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms