RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 FEM1BQ9UK73 627 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 B9A039 149 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TEX22C9J3V5 150 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRF1P10914 325 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEACAM1P13688 526 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACADSP16219 412 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNAZP19086 355 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR2F2P24468 414 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 MLLT10P55197 1068 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNJ10P78508 379 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACVR2BQ13705 512 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 POSTNQ15063 836 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 FRG2Q64ET8 278 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC174Q6PII3 467 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 MOGAT3Q86VF5 341 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 C2CD5Q86YS7 1000 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRHL3Q8TE85 626 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYT11Q9BT88 431 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 STK36Q9NRP7 1315 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 C2orf42Q9NWW7 574 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXL2Q9UKC9 423 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNJ14Q9UNX9 436 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PPI3 338 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 HS3ST1O14792 307 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLIN1O60240 522 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSPAN3O60637 253 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSHBP01222 138 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLA2G4BP0C869 781 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 BMXP51813 675 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 MBTD1Q05BQ5 628 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 RUNX1T1Q06455 604 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TDGQ13569 410 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ENPP2Q13822 863 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIR2DS3Q14952 304 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA1644Q3SXP7 199 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIGIRRQ6IA17 410 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM81Q6P7N7 255 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 HAPLN4Q86UW8 402 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLD5Q8N7P1 536 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP38Q8NB14 1042 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 SVIPQ8NHG7 77 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHF21AQ96BD5 680 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 RHBDF1Q96CC6 855 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABHD8Q96I13 439 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGAP3Q96P47 875 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCGF6Q9BYE7 350 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TKTL2Q9H0I9 626 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLCB1Q9NQ66 1216 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 C20orf141Q9NUB4 165 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACAD8Q9UKU7 415 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PADI3Q9ULW8 664 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR5K3A6NET4 321 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLOD2O00469 737 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 VCYO14598 125 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEC14L5O43304 696 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 FTCDO95954 541 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 HMBSP08397 361 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNPP09543 421 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TYMPP19971 482 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 MSH3P20585 1137 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPD2P43304 727 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR2C2P49116 596 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPP30P78346 268 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYLK3Q32MK0 819 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 TUBB8Q3ZCM7 444 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASPRV1Q53RT3 343 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCST1Q5T197 706 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF774Q6NX45 483 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC22A25Q6T423 547 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 PQLC2Q6ZP29 291 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 BEST3Q8N1M1 668 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 BMPERQ8N8U9 685 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 RDM1Q8NG50 284 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-277P-201ENST00000516272 THAP6Q8TBB0 222 aa2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms