RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 MAML1Q92585 1016 aa26.14■■□□□ 1.78
PBRM1-218ENST00000458294 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PBRM1-218ENST00000458294 RMI1Q9H9A7 625 aa26.14■■□□□ 1.78
PBRM1-218ENST00000458294 AMACRQ9UHK6 382 aa26.14■■□□□ 1.78
PBRM1-218ENST00000458294 NKX2-8O15522 239 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 CA4P22748 312 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 GARSP41250 739 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 ABHD18Q0P651 414 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 CDC20Q12834 499 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 FILIP1LQ4L180 1135 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 IYDQ6PHW0 289 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 SLC9B2Q86UD5 537 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 NCSTNQ92542 709 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 LYSMD1Q96S90 227 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 CTRCQ99895 268 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 HERPUD2Q9BSE4 406 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 EPB41L1Q9H4G0 881 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 TBC1D29Q9UFV1 150 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 CHKBQ9Y259 395 aa26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 IL4RP24394 825 aa26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 CASRP41180 1078 aa26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF165P49910 485 aa26.12■■□□□ 1.77
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PBRM1-218ENST00000458294 GALNT2Q10471 571 aa26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 NFATC2Q13469 925 aa26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 SKIDA1Q1XH10 827 aa26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 FATE1Q969F0 183 aa26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 IP6K2Q9UHH9 426 aa26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 PRKAB1Q9Y478 270 aa26.12■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 A6NCN8 305 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 MATN3O15232 486 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 MFSD11O43934 449 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 STK17BO94768 372 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 CLDN7O95471 211 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 SKILP12757 684 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 MC1RQ01726 317 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 IHHQ14623 411 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC122Q5T0U0 273 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 AVL9Q8NBF6 648 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 FAM71BQ8TC56 605 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 KCNK6Q9Y257 313 aa26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 A0A0G2JNG1 304 aa26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 KIR2DS3K7RE56 304 aa26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 PRKAR1AP10644 381 aa26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 F3P13726 295 aa26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 KIR2DS5Q14953 304 aa26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 KDELC2Q7Z4H8 507 aa26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 WDR24Q96S15 920 aa26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 APMAPQ9HDC9 416 aa26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
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PBRM1-218ENST00000458294 TTLL3Q9Y4R7 772 aa26.1■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 OR5K4A6NMS3 321 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 PRLP01236 227 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 ACP5P13686 325 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 CCNCP24863 283 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 MAPK9P45984 424 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 SPINT3P49223 89 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 FOXK1P85037 733 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 TYRO3Q06418 890 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 MMRN1Q13201 1228 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 MAP7Q14244 749 aa26.09■■□□□ 1.77
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PBRM1-218ENST00000458294 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa26.09■■□□□ 1.77
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PBRM1-218ENST00000458294 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 LPCAT1Q8NF37 534 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 ARRDC2Q8TBH0 407 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 STARD8Q92502 1023 aa26.09■■□□□ 1.77
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PBRM1-218ENST00000458294 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 THAP2Q9H0W7 228 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 FAM83DQ9H4H8 585 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 PCDH9Q9HC56 1237 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 PKD2L2Q9NZM6 624 aa26.09■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa26.08■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 RGSL1A5PLK6 1076 aa26.08■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 DLGAP3O95886 979 aa26.08■■□□□ 1.77
PBRM1-218ENST00000458294 CD48P09326 243 aa26.08■■□□□ 1.77
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