RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439372.5

ATP6AP1-204, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene ATP6AP1, Length 604 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-204ENST00000439372 FZD2Q14332 565 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 IL27RAQ6UWB1 636 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 TRAM1L1Q8N609 369 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 IFT81Q8WYA0 676 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 LRRC39Q96DD0 335 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 IL26Q9NPH9 171 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CCDC78A2IDD5 438 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 C4orf47A7E2U8 309 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 ITGA9Q13797 1035 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 SHBQ15464 509 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 TRADDQ15628 312 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 STPG1Q5TH74 334 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CENPUQ71F23 418 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 MPP5Q8N3R9 675 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 NAT9Q9BTE0 207 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 LGR4Q9BXB1 951 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 WDR26Q9H7D7 661 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 FKBPLQ9UIM3 349 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PSMA3P25788 255 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 THOP1P52888 689 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 IL9RQ01113 521 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CUL1Q13616 776 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PTK2BQ14289 1009 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 NFATC4Q14934 902 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 FAM151BQ6UXP7 276 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CCNJLQ8IV13 435 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 ZNF398Q8TD17 642 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PWWP2AQ96N64 755 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 A0A1B0GTQ1 180 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 H7C0S8 307 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 POLBP06746 335 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PAMP19021 973 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 HTR1BP28222 390 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 KIAA1024LP59773 190 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PRAMEP78395 509 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 ACVR1Q04771 509 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CHRNA6Q15825 494 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 UAP1L1Q3KQV9 507 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 MSS51Q4VC12 460 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 KCTD16Q68DU8 428 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 MACC1Q6ZN28 852 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 HDAC10Q969S8 669 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 HIC2Q96JB3 615 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 TBATAQ96M53 351 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 ZNF778Q96MU6 729 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 TEX101Q9BY14 249 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 KLF15Q9UIH9 416 aa22.91■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CCL22O00626 93 aa22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PRAMEF1O95521 474 aa22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 TTC4O95801 387 aa22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 PGAM1P18669 254 aa22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 ITGALP20701 1170 aa22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 KELP23276 732 aa22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 NMBRP28336 390 aa22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 MC4RP32245 332 aa22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CDK3Q00526 305 aa22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 CBLBQ13191 982 aa22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1-204ENST00000439372 TRIM74Q86UV6 250 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms